人皮肤成纤维细胞蛋白质特征谱提示其可作为神经肌肉疾病体外模型的适用性(库数据)

Andreas Hentschel,人皮肤成纤维细胞的蛋白质特征谱提示其可作为神经肌肉疾病体外模型的适用性(库数据)[数据集]

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蛋白质神经系统疾病神经肌肉疾病皮肤成纤维细胞蛋白质特征谱体外模型PRIDE
Protein signature of human skin fibroblasts indicates the suitability to serve as in vitro model for neuromuscular diseases (Library Data)

基本信息

模态
蛋白质
创建/更新时间
2026-10-24

资源简介

人皮肤成纤维细胞蛋白质特征谱提示其可作为神经肌肉疾病体外模型的适用性(库数据)

该数据集英文名称为 Protein signature of human skin fibroblasts indicates the suitability to serve as in vitro model for neuromuscular diseases (Library Data),由 Andreas Hentschel 提交,属于神经系统疾病 / 其他分类,来源站为 ebi.ac.uk。数据集围绕人皮肤成纤维细胞的蛋白质特征谱展开,其核心命题是:这类细胞的蛋白质特征谱可提示其作为神经肌肉疾病体外模型的适用性。该数据集以库数据(Library Data)形式发布,可通过 PRIDE 归档项目 PXD019060 访问。整体而言,它为研究者在体外模型层面理解神经肌肉疾病相关细胞特征提供了一个蛋白质组学层面的数据资源,适合作为方法学参考与后续分析的基础材料。

【数据集背景】

神经肌肉疾病的研究长期依赖合适的体外细胞模型。人皮肤成纤维细胞因取材相对便利,被视为潜在的体外模型候选,但其是否具备反映神经肌肉疾病相关特征的蛋白质基础,需要以蛋白质组学证据加以评估。该数据集正是围绕这一评估问题组织的数据资源,其标题直接点明了研究意图:通过人皮肤成纤维细胞的蛋白质特征谱,判断其作为神经肌肉疾病体外模型的适用性。数据集以库数据形式发布,说明其定位偏向可复用的数据集合,而非单一结论性报告。

【数据内容】

依据源站描述,该数据集为 Andreas Hentschel 提交的库数据,主题为人皮肤成纤维细胞的蛋白质特征谱及其与神经肌肉疾病体外模型适用性的关联。数据集在站内归入神经系统疾病 / 其他分类。关于具体样本数量、蛋白质鉴定数目、实验分组、文件格式与数据规模等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk,源站描述中给出的访问地址为 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019060,表明其通过 PRIDE 归档项目发布。提交者为 Andreas Hentschel。关于样本采集地点、供体信息、细胞培养条件、质谱平台与仪器参数等采集细节,源站未提供。

【适用场景】

基于数据集的主题定位,其适用场景包括:评估人皮肤成纤维细胞作为神经肌肉疾病体外模型的可行性;将本数据集的蛋白质特征谱作为参照,与相关细胞或疾病模型数据进行比较分析;在神经肌肉疾病相关研究中作为蛋白质组学层面的背景数据使用。关于具体可支持的疾病亚型、分析流程或验证实验,源站未提供。

【使用方法】

该数据集以库数据形式发布,可通过源站给出的 PRIDE 项目地址访问。关于下载方式、文件组织、检索接口、配套分析脚本或使用协议等技术细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为库数据,其内容与结论范围以源站描述为准。关于数据完整性、重复性、定量准确性、样本代表性以及是否经过独立验证等质量信息,源站未提供。使用时应结合源站页面信息自行评估适用性。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参照源站描述中的形式:Andreas Hentschel, Protein signature of human skin fibroblasts indicates the suitability to serve as in vitro model for neuromuscular diseases (Library Data) [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019060。关于许可条款与使用限制,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019060

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Andreas Hentschel,人皮肤成纤维细胞的蛋白质特征表明其适合作为神经肌肉疾病的体外模型(图书馆数据)[数据集]。https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019060

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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