PRJNA597339:降低IDOL治疗改善APP/PS1小鼠淀粉样变性和认知功能

针对E3泛素连接酶IDOL的反义寡核苷酸(ASO)在大脑中显著减少了Aβ病理,并改善了APP/PS1小鼠的空间学习与记忆

ena
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基因组分类神经系统疾病阿尔茨海默病APP/PS1小鼠反义寡核苷酸IDOLDrop-Seq淀粉样变性
PRJNA597339: Therapeutic IDOL reduction ameliorates amyloidosis and improves cognitive function in APP/PS1 mice

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

PRJNA597339:降低IDOL治疗改善APP/PS1小鼠淀粉样变性和认知功能

PRJNA597339 数据集围绕 E3 泛素连接酶 IDOL 的靶向干预展开,对应研究题为“Therapeutic IDOL reduction ameliorates amyloidosis and improves cognitive function in APP/PS1 mice”。该研究利用反义寡核苷酸(ASO)抑制大脑中的 IDOL,在 APP/PS1 小鼠模型中观察到 Aβ 病理显著减少,同时空间学习与记忆能力得到改善。数据集记录了以 Drop-Seq 技术对 6 只 B6.Cg-Tg(APPswe,PSEN1dE9)85Dbo/Mmjax(005864)小鼠进行单细胞转录组分析的设计:其中 3 只接受 ASO 处理,3 只接受 PBS 处理,形成处理组与对照组的对照结构。该数据集归属于神经系统疾病 / 其他分类,来源站为 ebi.ac.uk,可用于了解 IDOL 干预对阿尔茨海默病模型小鼠脑组织转录组的影响。

【数据集背景】

阿尔茨海默病相关病理中,Aβ 沉积是核心特征之一。该研究关注 E3 泛素连接酶 IDOL 作为治疗靶点,通过反义寡核苷酸(ASO)降低大脑中 IDOL 的水平,并在 APP/PS1 转基因小鼠中评估其对淀粉样变性和认知功能的作用。源站描述指出,针对 IDOL 的 ASO 在大脑中显著减少了 Aβ 病理,并改善了 APP/PS1 小鼠的空间学习与记忆。数据集即为该研究整体设计中的单细胞转录组部分,采用 Drop-Seq 对小鼠样本进行测序分析。

【数据内容】

数据内容对应 Drop-Seq 在 6 只 B6.Cg-Tg(APPswe,PSEN1dE9)85Dbo/Mmjax(005864)小鼠上的实施结果。实验分组为:3 只小鼠接受 ASO 处理,3 只小鼠接受 PBS 处理。源站未提供具体的细胞数量、基因表达矩阵规模、测序深度、样本组织部位等细节。数据集分类为神经系统疾病 / 其他,英文名称为 PRJNA597339: Therapeutic IDOL reduction ameliorates amyloidosis and improves cognitive function in APP/PS1 mice。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ebi.ac.uk。样本来自 6 只 B6.Cg-Tg(APPswe,PSEN1dE9)85Dbo/Mmjax(005864)小鼠,按处理方式分为 ASO 组和 PBS 组,每组 3 只。整体设计采用 Drop-Seq 进行单细胞转录组测序。源站未提供样本采集的具体脑区、时间点、ASO 给药方式与剂量、PBS 对照的具体匹配方式等信息。

【适用场景】

该数据集适用于研究与 IDOL 抑制相关的脑组织转录组变化,尤其是 APP/PS1 小鼠模型中 ASO 处理与 PBS 对照之间的单细胞水平差异。可用于探索 Aβ 病理减少和空间学习记忆改善背景下可能的细胞类型与表达程序变化。由于分类为神经系统疾病 / 其他,也可作为神经系统疾病相关单细胞转录组数据的参考。源站未提供该数据集在其他具体研究场景中的适用性说明。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明,包括数据下载方式、文件格式、分析流程、质控标准或注释信息。使用者需依据来源站 ebi.ac.uk 的公开页面进一步获取相关数据与说明。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估指标、批次信息、重复性验证或技术限制说明。已知样本量为 6 只小鼠,分为 ASO 与 PBS 两组各 3 只;源站未提供更详细的样本元数据、测序质量参数或潜在混杂因素说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA597339

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

针对脑中E3泛素连接酶IDOL的反义寡核苷酸(ASO)显著减少了APP/PS1小鼠的Aβ病理,并改善了其空间学习与记忆能力。总体设计:对6只B6.Cg-Tg(APPswe,PSEN1dE9)85Dbo/Mmjax(005864)小鼠进行了Drop-Seq。其中3只小鼠接受ASO处理,3只接受PBS处理。

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