adamts17敲除斑马鱼转录组分析：孕酮信号、类固醇生成与昼夜节律行为的多效性作用

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1437266

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在以斑马鱼为模式生物，探究ADAMTS17的生理功能。ADAMTS17是一种分泌型金属蛋白酶，与人类Weill-Marchesani综合征相关。我们通过CRISPR/Cas9技术构建了adamts17敲除斑马鱼，并对成年雄性和雌性的四种组织（性腺、脑、眼和骨骼）进行了RNA-seq，每种性别每种基因型（野生型和adamts17-/-）设置四个生物学重复。主要目标是鉴定受adamts17缺失影响的组织特异性转录变化和基因共表达网络，尤其关注生殖和神经行为系统。该数据集为理解ADAMTS17相关疾病的分子机制及其在脊椎动物性激素调控、类固醇代谢和昼夜节律维持中的保守作用提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。