11月龄Cabin1突变ALS小鼠模型腹侧脊髓单核RNA测序
该数据集来自NCBI，对11月龄野生型与Cabin1杂合突变小鼠脊髓腹侧灰质的单核RNA测序数据，共两个样本（WT与HET），每种基因型各两个重复
基本信息
资源简介
11月龄Cabin1突变ALS小鼠模型腹侧脊髓单核RNA测序
该数据集为来自 NCBI 的单核 RNA 测序数据，聚焦于一种与肌萎缩侧索硬化（ALS）相关的 Cabin1 突变小鼠模型。研究以 11 月龄小鼠为对象，对脊髓腹侧灰质进行单核 RNA 测序，比较野生型（WT）与 Cabin1 杂合突变（Cabin1 HET）两种基因型。数据集共包含两个样本，分别对应 WT 与 HET，每种基因型各设两个重复。其目标在于从转录组层面刻画 Cabin1 突变相关 ALS 发病机制，并在疾病进展晚期提供脊髓内不同细胞类型基因表达变化的高分辨率图谱。该数据属于神经系统疾病范畴，主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads），适合用于探索 Cabin1 缺陷所扰乱的细胞类型特异性表达特征。
【数据集背景】
肌萎缩侧索硬化是一种累及运动神经元的神经系统疾病，其发病机制涉及复杂的转录组改变。该数据集围绕 Cabin1 突变与 ALS 发病机制之间的关联展开，旨在阐明其背后的转录组学机制。研究选用 11 月龄小鼠，这一时间点对应疾病进展晚期，有助于观察晚期阶段脊髓内的转录变化。通过比较野生型与 Cabin1 杂合突变小鼠，该数据集为理解 Cabin1 缺陷如何影响脊髓细胞状态提供了基础数据。
【数据内容】
该数据集由单核 RNA 测序数据组成，测序对象为小鼠脊髓腹侧灰质。样本设计包括野生型（WT）与 Cabin1 杂合突变（Cabin1 HET）两种基因型，共两个样本，每种基因型各有两个重复。数据主题标签为原始测序读段（Raw sequence reads）。这些数据旨在提供疾病进展晚期脊髓转录变化的高分辨率图谱，并支持鉴定不同细胞类型中受 Cabin1 缺陷影响的基因表达水平。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。数据集英文名称为“PRJNA1421123: Single-nucleus RNA-seq profiling of the ventral spinal cord in an 11-month-old Cabin1 mutant mouse model of ALS”。源站描述指出，该项目对 11 月龄野生型与 Cabin1 杂合突变小鼠脊髓腹侧灰质进行了单核 RNA 测序。关于具体的测序平台、建库方法、测序深度、组织处理流程等实验细节，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于研究与 ALS 相关的转录组机制，尤其是与 Cabin1 突变相关的病理过程。由于提供了脊髓腹侧灰质的单核 RNA 测序数据，可用于分析不同细胞类型在疾病晚期的基因表达变化，识别受 Cabin1 缺陷扰乱的细胞类型特异性表达特征。也可用于比较野生型与 Cabin1 杂合突变小鼠之间的转录差异，为后续机制研究提供数据基础。关于是否适用于其他物种、其他脑区或其他疾病模型，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以原始测序读段（Raw sequence reads）形式提供，使用前通常需要进行序列比对、定量与细胞类型注释等标准单核 RNA 测序分析流程。由于数据集包含 WT 与 HET 两种基因型、每种各两个重复，分析时可围绕基因型间的差异表达与细胞类型组成变化展开。关于具体的分析软件、参考基因组版本、标准化流程或推荐参数，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集每种基因型仅有两个重复，样本量较小，可能限制统计功效。数据仅针对 11 月龄小鼠脊髓腹侧灰质，时间点和组织区域均较特定，结论外推需谨慎。关于测序质量、细胞捕获数、基因检出数、批次效应或污染控制等信息，源站未提供。此外，该数据集仅涉及野生型与 Cabin1 杂合突变两种基因型，未包含其他突变类型或干预条件。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。使用时应参考 NCBI 来源页面的相关说明。
下载信息
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暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1421123
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本项目旨在阐明与Cabin1突变相关的肌萎缩侧索硬化症（ALS）发病机理背后的转录组机制。我们对11个月大的野生型（WT）和杂合子（Cabin1 HET）小鼠脊髓腹侧灰质进行了单核RNA测序。数据集包含两个样本（WT和HET），每种基因型有两个重复。这些数据提供了疾病晚期进展过程中脊髓转录变化的高分辨率图谱，有助于识别由Cabin1缺陷导致的不同细胞类型中基因表达水平的扰动。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
