海马体预配置动力学受胚胎出生日期与神经发生速率引导

主题标签:海马体、神经发生、胚胎出生日期、神经生理学、NWB、BRAIN Initiative、神经系统疾病。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集,主题涵盖海马体。

dandi
2023-05-23 更新
浏览 16
其他预测海马体神经发生胚胎出生日期神经生理学NWBBRAIN Initiative神经系统疾病
Preconfigured dynamics in the hippocampus are guided by embryonic birthdate and rate of neurogenesis

基本信息

模态
其他
任务类型
预测
创建/更新时间
2023-05-23
版本
0.230630.2304

资源简介

海马体预配置动力学受胚胎出生日期与神经发生速率引导

该数据集英文名为 Preconfigured dynamics in the hippocampus are guided by embryonic birthdate and rate of neurogenesis,来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 000552。它属于神经系统疾病 / 其他分类,是一项遵循 NWB 标准的神经生理学数据集,与 BRAIN Initiative 相关,联系人为 Huszár, Roman。其主题涵盖海马体、神经发生、胚胎出生日期、神经生理学、NWB、BRAIN Initiative 以及神经系统疾病等方向。整体来看,该数据集面向神经系统疾病领域的公开数据共享,核心关注海马体相关神经生理活动,并围绕胚胎出生日期与神经发生速率如何引导海马体预配置动态这一主题组织数据,适合用于神经科学和神经系统疾病相关研究中的数据分析与再利用。

【数据集背景】

该数据集的主题背景集中在海马体、神经发生、胚胎出生日期以及神经生理学等方向。海马体是神经系统疾病研究中的重要脑区,而神经发生与胚胎出生日期则涉及神经系统发育过程。数据集名称表明其研究关注海马体中预配置动态如何受到胚胎出生日期和神经发生速率的引导。该数据集被归入神经系统疾病 / 其他分类,说明其既可能与神经系统疾病研究相关,也可能作为该领域下的其他类型数据资源使用。来源站为 dandiarchive.org,源站描述指出其为 DANDI Archive 的 dandiset 000552,并属于 NWB 标准的神经生理学数据集,同时与 BRAIN Initiative 相关。联系人信息为 Huszár, Roman。

【数据内容】

该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,主题标签包括海马体、神经发生、胚胎出生日期、神经生理学、NWB、BRAIN Initiative 和神经系统疾病。其核心内容围绕海马体预配置动态、胚胎出生日期以及神经发生速率之间的关系展开。数据以 NWB 标准组织,属于神经生理学数据范畴。除上述主题和标准信息外,源站未提供更细粒度的数据内容说明,例如具体记录类型、通道数量、动物样本量、实验条件或分析指标等。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 000552。源站描述其为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。联系人标注为 Huszár, Roman。除来源站、数据集编号、标准格式、所属计划和联系人外,源站未提供关于采集设备、采集地点、实验方案、样本来源或具体采集时间的进一步信息。

【适用场景】

该数据集适用于神经系统疾病领域的研究,尤其是与海马体、神经发生、胚胎出生日期和神经生理学相关的分析场景。由于其为 NWB 标准的神经生理学数据集,可用于神经生理数据的读取、共享、复用和再分析。其主题涉及海马体预配置动态与神经发生,因此也可能适用于研究神经系统发育过程、海马体功能组织以及相关神经系统疾病机制的场景。此外,作为 BRAIN Initiative 相关数据资源,它可用于公开数据共享和协作研究。除这些由主题和来源直接支持的方向外,源站未提供更具体的适用场景说明。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准提供,可通过 DANDI Archive 获取,数据集编号为 dandiset 000552。使用者可依据 NWB 标准工具链读取和处理数据。由于来源站为 dandiarchive.org,访问和下载应通过该平台进行。联系人信息为 Huszár, Roman,可用于与该数据集相关的沟通。除上述获取方式、标准格式和联系人外,源站未提供关于预处理步骤、推荐分析流程、软件依赖或使用教程的进一步说明。

【质量与限制】

该数据集为 DANDI Archive 公开数据集,遵循 NWB 标准,并与 BRAIN Initiative 相关,这些信息支持其在神经生理数据共享中的规范性和可复用性。其主题明确涵盖海马体、神经发生、胚胎出生日期和神经生理学,并归入神经系统疾病 / 其他分类。然而,源站未提供关于数据质量评估、缺失值、噪声水平、样本量、重复性、验证结果或已知偏差的具体信息。因此,在使用时需注意这些限制,并结合自身研究目的进行判断。除来源站描述和主题标签外,源站未提供更详细的质量控制或限制说明。

【引用与许可】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 中的 dandiset 000552,联系人为 Huszár, Roman。源站描述其为 NWB 标准的神经生理学数据集,并与 BRAIN Initiative 相关。除上述信息外,源站未提供关于引用格式、许可协议、使用条款或版权归属的具体说明。使用者如需引用或使用该数据集,应前往 DANDI Archive 对应页面查看最新、最准确的引用与许可信息。

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源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000552

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 000552. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Huszár, Roman.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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