识别脑室外引流相关感染的新型诊断方法

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT05904535

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

条件：脑室引流相关感染、医院获得性感染、细菌感染、脑室炎、感染性。文献报道的置入引流管感染发生率为1-35%。这种差异源于缺乏关于脑室外引流相关感染（EVDI）定义的国际共识，以及各研究采用了不同的诊断标准。在神经重症监护环境中，由于基础疾病的存在，临床症状往往难以评估。脑脊液（CSF）细菌培养是目前EVDI诊断的金标准。然而，脑脊液细菌培养通常需要数天才能最终确定，且先前使用抗生素可能进一步延长培养孵育时间或导致培养假阴性。很少有可能延迟治疗直至细菌培养最终确定。此外，由于这些感染的病因学特点，仅凭培养出的细菌难以区分污染与真阳性。因此，EVDI的早期识别依赖于细菌感染的间接征象，即脑脊液中葡萄糖、乳酸、蛋白质、白细胞和红细胞的分析。

在神经危重症患者中，脑脊液参数常受到脑室内出血（IVH）的干扰。尤其是白细胞和红细胞，其数量可能因IVH体积的不同而差异很大。为校正IVH的影响，通常使用脑脊液中白细胞与红细胞的比值（LE比值），该比值是识别EVDIs的主要指标之一。LE比值基于红细胞和白细胞在脑脊液中均匀分布的假设。这一假设此前从未受到质疑。然而，从计算机断层扫描（CT）可以清楚地看到，血液在脑室中沉积，这表明均匀分布不太可能。LE比值未能考虑到血液本身会引起无菌性炎症，从而导致白细胞迁移这一事实。此外，白细胞，特别是粒细胞，可能表现出上浮或抗沉降特性，而这一特性在危重症患者中被证明会加剧。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。