NEXMIF脑病:家系WES数据的DeNovogear输出

发育性癫痫性脑病(DEE)是最严重的一类癫痫。近期研究表明,NEXMIF突变可在女性中导致DEE,其特征为肌阵挛-失张力癫痫和复发性非惊厥性癫痫持续状态

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基因组分类NEXMIF脑病发育性癫痫性脑病全外显子测序家系数据神经影像视觉敏感性癫痫
NEXMIF encephalopathy: DeNovogear output of WES data of the family

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
许可
CC0 1.0 Universal (CC0 1.0) Public Domain Dedication
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

NEXMIF脑病:家系WES数据的DeNovogear输出

NEXMIF encephalopathy: DeNovogear output of WES data of the family 是一个面向神经系统疾病研究的公开数据集,聚焦于NEXMIF基因新发突变相关的发育性癫痫性脑病(DEE)。发育性癫痫性脑病是癫痫中最严重的一类,近期研究显示NEXMIF突变可在女性中导致此类疾病,典型表现为肌阵挛-失张力癫痫和复发性非惊厥性癫痫持续状态。该数据集收录了一个家系的全外显子组测序(WES)新发突变分析输出结果,对应一例携带新型NEXMIF新发突变、表现为复发性失神持续状态伴眼睑肌阵挛的患者。数据集在站内归入神经系统疾病下的“其他”类别,来源于search.dataone.org,并以CC0 1.0公共领域贡献许可开放共享,可供癫痫遗传学与神经影像相关研究参考使用。

【数据集背景】

发育性癫痫性脑病(DEE)是癫痫中最严重的一组疾病。近年来的研究证据表明,NEXMIF基因突变可在女性中引起DEE,其临床特征包括肌阵挛-失张力癫痫以及复发性非惊厥性癫痫持续状态。本数据集所对应的研究进一步报告了一例携带新型NEXMIF新发突变、以复发性失神持续状态伴眼睑肌阵挛为表现的患者,并借助先进神经影像技术揭示其脑结构与功能改变,从而将临床表型与特定脑网络的变化联系起来。研究发现,该患者的改变涉及视觉距状裂周围皮层与额中回,这些区域已被证明是伴视觉敏感性和眼睑肌阵挛伴失神的癫痫表型的核心特征。数据集名称中的“DeNovogear”指向家系WES数据的新发突变分析输出,说明其定位是支撑该类家系遗传学发现的数据资源。

【数据内容】

该数据集的内容为家系全外显子组测序(WES)数据的新发突变分析输出,即围绕上述NEXMIF新发突变家系产生的测序分析结果。数据集名称明确指向“family”层面的WES数据,表明其覆盖的是家系成员的外显子组测序信息及其新发突变识别结果。除名称与源站描述所体现的这一范围外,关于样本数量、文件格式、数据体积、具体变异位点列表、注释字段等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于search.dataone.org。源站描述交代了其研究背景:针对一例携带新型NEXMIF新发突变、表现为复发性失神持续状态伴眼睑肌阵挛的患者,研究采用先进神经影像技术,以揭示可导致临床表型在特定脑网络内发生改变的脑结构与功能变化。该数据集即为这一研究背景下家系WES数据的新发突变分析输出。关于测序平台、样本采集地点与时间、伦理审批信息等,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于以下方向:NEXMIF相关发育性癫痫性脑病的遗传学研究,尤其是女性患者中肌阵挛-失张力癫痫与复发性非惊厥性癫痫持续状态表型的分子基础探索;家系全外显子组测序中新发突变的识别与验证;以及将遗传发现与神经影像所揭示的脑结构与功能改变(如视觉距状裂周围皮层和额中回受累)相结合的表型-网络关联研究。对于伴视觉敏感性和眼睑肌阵挛伴失神的癫痫表型研究,该数据集亦可作为家系遗传学证据的参考。其他具体应用方式源站未提供。

【使用方法】

该数据集以家系WES数据的新发突变分析输出形式提供,使用者可将其用于新发突变的复核、家系共分离分析思路的参考,以及与神经影像发现的联合解读。关于具体的下载方式、文件组织、分析流程与推荐工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集对应的是单一家系的研究性测序分析输出,其结论建立在特定患者与特定家系之上,外推至更广泛NEXMIF突变人群时需谨慎。源站描述聚焦于该例患者的临床表型与神经影像改变,未提供测序深度、覆盖度、变异验证方法、数据完整性评估等质量指标,相关质量信息源站未提供。使用者应注意其作为研究数据而非临床诊断产品的定位。

【引用与许可】

该数据集采用CC0 1.0 Universal(CC0 1.0)公共领域贡献许可,允许在公共领域范围内自由使用。使用时应遵循该许可条款;关于具体的引用格式、推荐引用文献与致谢要求,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://search.dataone.org/view/sha256%3A6fff9c2b9dd3cab448dbb2e85ce632552a589e045cf56c31119ea767794a180f

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

发育性和癫痫性脑病(DEE)是最严重的一类癫痫。近年来,已证实NEXMIF突变可在女性中导致一种DEE,其特征为肌阵挛-失张力性癫痫和反复发作的非惊厥性持续状态。在本研究中,我们对一名携带新型NEXMIF新发突变、表现为反复失神持续状态伴眼睑肌阵挛的患者应用了先进神经影像技术,以揭示可将临床表型引向特定脑网络内改变的大脑结构与功能变化。实际上,该患者所发现的改变涉及视觉距状沟周围皮层和额中回,这些区域已被证实是伴视觉敏感性癫痫表型以及伴失神的眼睑肌阵挛的核心特征。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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