MC_Maze_Large:延迟伸够期间猕猴初级运动皮层与背侧前运动皮层锋电位活动

该数据集属于 BRAIN Initiative 相关神经生理学数据发布工作的一部分,托管于 DANDI Archive。DANDI Archive 是面向神经科学领域的公共数据归档平台,主要收录以 NWB(Neurodata Without Borders)标准组织的电生理与相关神经科学数据,其目标

dandi
2021-09-02 更新
浏览 18
时间序列分类神经电生理尖峰放电NWB数据运动皮层延迟伸手运动解码脑机接口神经系统疾病
MC_Maze_Large: macaque primary motor and dorsal premotor cortex spiking activity during delayed reaching

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2021-09-02
版本
0.220113.0407

资源简介

MC_Maze_Large:延迟伸够期间猕猴初级运动皮层与背侧前运动皮层锋电位活动

该数据集名为 MC_Maze_Large: macaque primary motor and dorsal premotor cortex spiking activity during delayed reaching,记录了猕猴在执行延迟伸够任务过程中,初级运动皮层与背侧前运动皮层的神经元脉冲发放活动,以 NWB 标准格式发布,来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 000138。

【数据集背景】

该数据集属于 BRAIN Initiative 相关神经生理学数据发布工作的一部分,托管于 DANDI Archive。DANDI Archive 是面向神经科学领域的公共数据归档平台,主要收录以 NWB(Neurodata Without Borders)标准组织的电生理与相关神经科学数据,其目标是让实验数据在共享、复用和长期保存方面具备统一的结构规范。该数据集所在的分类为“神经系统疾病 / 其他”。数据集的联系人信息为 Pei, Felix。除上述信息外,关于该数据集的具体研究项目背景、资助来源与实验设计动机,源站未提供。

【数据内容】

依据数据集名称,其内容为猕猴(macaque)初级运动皮层(primary motor cortex)与背侧前运动皮层(dorsal premotor cortex)在延迟伸够(delayed reaching)任务期间的脉冲发放(spiking activity)信号。初级运动皮层与背侧前运动皮层是运动控制环路中的关键区域,前者与肢体运动的执行密切相关,后者更多参与运动准备、感觉—运动整合与动作规划;延迟伸够范式通常将“提示—等待—动作”分为若干阶段,便于区分运动准备期与运动执行期的神经活动。数据集名称中的 MC_Maze 提示其任务与运动皮层相关的迷宫式伸够范式有关,Large 字样表明这是该系列中规模较大的一个版本。关于具体记录了多少只动物、多少个记录 session、多少个神经元单元、多少试次,以及是否同时包含局部场电位、行为学时间戳或眼动信号,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 dandiarchive.org,对应 DANDI Archive 的 dandiset 000138,采用 NWB 标准进行组织,属于 BRAIN Initiative 相关神经生理学数据。联系人为 Pei, Felix。关于电极类型、记录设备、采样率、滤波参数、手术与伦理审批信息、以及数据采集所在实验室与机构,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于运动皮层神经生理学的分析性研究,例如考察初级运动皮层与背侧前运动皮层在延迟伸够任务不同阶段中的发放模式差异、群体编码与运动参数之间的关系,以及运动准备与运动执行阶段的神经表征。也可作为神经解码研究的素材,用于构建从脉冲活动到运动意图或运动学参数的解码模型。由于数据以 NWB 标准发布,适合纳入标准化的电生理分析流程与跨数据集比较研究。关于该数据集是否适用于特定疾病模型、临床转化或脑机接口研究,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集需通过 DANDI Archive 获取 dandiset 000138,并以支持 NWB 格式的工具链读取。NWB 是神经科学领域常用的开放数据标准,围绕它已形成多种读取、可视化与转换工具。关于该数据集的具体下载方式、版本号、目录结构、配套代码或分析示例,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集以 NWB 标准组织,这为其结构一致性提供了基础规范。除此之外,关于数据质量评估结果、信噪比、单元筛选标准、缺失数据情况、批次效应以及已知的使用限制,源站未提供。使用者在开展分析前应自行核查数据质量与适用范围。

【引用与许可】

该数据集托管于 dandiarchive.org,对应 dandiset 000138,联系人为 Pei, Felix。关于正式引用格式、作者列表、版本 DOI 以及数据使用许可与再分发条款,源站未提供;使用与发表前应向数据发布方确认相应的引用与许可要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000138

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 000138。符合 NWB 标准的神经生理学数据集(BRAIN Initiative)。联系人:Pei, Felix。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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