高通量组学技术用于免疫细胞网络识别复发性急性播散性脑脊髓炎生物标志物

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT06863974

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：急性播散性脑脊髓炎、自身免疫性脑炎。急性播散性脑脊髓炎（ADEM）是一种中枢神经系统神经炎症性疾病，表现为意识障碍，甚至昏迷，以及多灶性神经功能缺损。ADEM是儿童中最常见的脑炎。此外，50-65%的儿童ADEM与抗MOG抗体（MOGAD）的存在相关。事实上，ADEM是儿童MOGAD最常见的临床表现，50-75%发生在10岁之前。在表现为ADEM的儿童MOGAD中，复发风险较高，高达30%，相比之下脊髓炎或视神经炎较低。多相性MOGAD更常伴有后遗症，占50-69%的病例，而单相性形式为4-32%。在ADEM中，认知和癫痫后遗症占主导地位。2020年欧洲联盟和2022年国家诊断与护理方案建议，早在疾病第二次发作时，或在出现远期后遗症时，即引入疾病修饰疗法，以限制复发和后遗症。然而，这些治疗需要数月才能见效。

目前，除了1年后血抗MOG抗体水平持续升高（≥1:1280）外，尚无可靠的预测因素可预测MOGAD复发。因此，本研究旨在从首次发作中识别与MOGAD复发相关的生物标志物。为此，我们将通过单细胞下一代RNA测序技术，研究抗MOGAD神经炎症复发的儿童循环血单核细胞的转录组。预判该疾病的多相轨迹将有助于引入早期疾病修正治疗，以预防复发和长期后遗症。此外，发现分子和/或细胞特征将有助于更好地理解ADEM和MOGAD的病理生理学。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。