Boxer犬SOD1纯合突变退行性脊髓病风险修饰基因GWAS数据集
该数据集来自 NCBI GEO，聚焦犬退行性脊髓病（DM）——一种与人类肌萎缩侧索硬化（ALS）高度相似的疾病。数据针对 SOD1 突变纯合的 Boxer 犬，采用 SNP 芯片进行全基因组关联研究，用于识别影响 DM 总体风险和发病年龄的修饰基因
基本信息
资源简介
Boxer犬SOD1纯合突变退行性脊髓病风险修饰基因GWAS数据集
Boxer dataset for genome-wide association study of modifiers of risk of canine degenerative myelopathy in dogs homozygous for SOD1 mutation
该数据集来自 NCBI GEO，聚焦犬退行性脊髓病（DM）——一种与人类肌萎缩侧索硬化（ALS）高度相似的疾病。数据针对 SOD1 突变纯合的 Boxer 犬，采用 SNP 芯片进行全基因组关联研究，用于识别影响 DM 总体风险和发病年龄的修饰基因。此前研究已发现 SOD1 突变，本数据进一步支持 SP110 作为修饰基因的发现。数据可用于犬与人类 ALS 风险及进展的遗传机制研究（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Apr 14 201。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：退行性脊髓病（DM）是一种与人类肌萎缩侧索硬化（ALS）非常相似的犬类疾病。我们此前已表明，DM 是 ALS 的一个有前景的模型，因为全基因组关联分析识别出 SOD1 中的一个突变，而 SOD1 是已知的 ALS 基因。在本研究中，我们识别出一个修饰基因 SP110，它在有 DM 风险的彭布罗克威尔士柯基犬中强烈影响总体疾病风险和发病年龄。在模型生物中剖析该疾病的复杂遗传学，可能为犬和人类患者的风险与进展带来新见解。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：SNP genotyping by SNP array、GPL17481、9615。本站分类：神经系统疾病/其他。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE80315
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jun 01 201，引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
退行性脊髓病（DM）是一种与人类肌萎缩侧索硬化症（ALS）非常相似的犬类疾病。我们此前已表明，DM是ALS的一个有前景的模型，因为全基因组关联分析在SOD1（一个已知的ALS基因）中鉴定出了一个突变。在本研究中，我们鉴定出一个修饰基因SP110，该基因强烈影响处于DM风险中的彭布罗克威尔士柯基犬的总体疾病风险和发病年龄。在模型生物中剖析该疾病的复杂遗传学，可能为犬类和人类患者的风险与疾病进展带来新的认识。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
