恒河猴海马体稳态与慢性SIV CL757感染的空间转录组
该数据集为恒河猴海马体脑切片的空间转录组数据，采用Nanostring DSP平台，包含一个未感染对照和一个慢性SIV CL757感染样本
基本信息
资源简介
恒河猴海马体稳态与慢性SIV CL757感染的空间转录组
Spatial transcriptomics of the Rhesus Macaque Hippocampus during homeostasis and chronic SIV CL757 infection
该数据集为恒河猴海马体脑切片的空间转录组数据，采用Nanostring DSP平台，包含一个未感染对照和一个慢性SIV CL757感染样本。数据可用于识别SIV感染相关的差异表达基因、评估空间转录组在检测白细胞浸润中的效用，以及比较稳态与慢性感染下白细胞的定位（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Mar 19 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们使用Nanostring的DSP平台对来自一个未感染对照和一个慢性感染SIVCL757的恒河猴海马体脑切片进行了空间转录组分析。我们的目标是（1）确定哪些差异表达基因（DGEs）可归因于恒河猴海马体中的SIV感染，（2）确定空间转录组是否可作为识别SIV感染脑中白细胞浸润的工具，以及（3）检查稳态和慢性SIV感染下白细胞的定位。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL27943、9544。本站分类：神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261969
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 01 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE261969
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们使用Nanostring的DSP平台对恒河猴海马脑切片进行了空间转录组学分析，这些切片分别来自一只未感染的对照组和一只长期感染SIVCL757的个体。我们的目标是：(1) 确定哪些差异表达基因（DGEs）可归因于恒河猴海马中的SIV感染，(2) 确定空间转录组学能否作为识别SIV感染脑中白细胞浸润的工具，以及(3) 检查白细胞在稳态和慢性SIV感染中的定位。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
