混合阶段秀丽隐杆线虫神经元核ATAC-seq图谱
该数据集为混合阶段秀丽隐杆线虫神经元核的ATAC-seq图谱，包含1个文件（GSE260636_series_matrix.txt.gz），用于鉴定发育中神经系统开放染色质区域
基本信息
资源简介
混合阶段秀丽隐杆线虫神经元核ATAC-seq图谱
ATAC-seq Profiling of Mixed Stage C. elegans Neuronal Nuclei
该数据集为混合阶段秀丽隐杆线虫神经元核的ATAC-seq图谱，包含1个文件（GSE260636_series_matrix.txt.gz），用于鉴定发育中神经系统开放染色质区域。数据可用于与感兴趣转录因子的ChIP-seq数据比较，辅助识别仅在神经元中表达的ChIP-seq峰（相对于全虫普遍结合），并帮助确定EGL-43等因子的神经元特异性结合位点及NanoDam峰（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Feb 29 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：我们利用ATAC-seq旨在鉴定发育中的秀丽隐杆线虫神经系统中开放染色质的区域。该数据集用于确定染色质区域，并将其与感兴趣转录因子的ChIP-seq数据进行比较，以帮助我们识别仅在神经元中表达的ChIP-seq峰（相对于一般的全虫结合）。具体而言，由于EGL-43在包括神经元和体细胞性腺在内的许多组织中表达，ATAC-seq在识别神经元特异性ChIP-seq峰和感兴趣的NanoDam峰（GSE227552）方面特别有用。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：GPL13657、6239。本站分类：神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260636
【使用注意】
· 源站最后修改于 Sep 09 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE260636
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
我们利用ATAC-seq技术，旨在识别发育中秀丽隐杆线虫神经系统中开放染色质的区域。该数据集被用于确定染色质区域，并将其与感兴趣转录因子的ChIP-seq数据进行比较，以帮助我们识别仅在神经元中表达的ChIP-seq峰（相对于一般性、全虫体结合）。具体而言，由于EGL-43在多种组织中表达，包括神经元和体细胞性腺，ATAC-seq在识别神经元特异性ChIP-seq峰及感兴趣的NanoDam峰方面尤为有用（GSE227552）。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
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