后脑边界细胞的神经祖细胞/干细胞特性数据集
该数据集来自 NCBI GEO(GSE230804),研究鸡胚后脑边界细胞的神经祖细胞/干细胞特性。基于 CSPG 表达模式,用 FACS 分离 CSPG 阳性与阴性细胞,每组 4-6 个生物学重复(每个重复含 30 个后脑的细胞),进行 RNA 测序,用于基因表达谱分析和不同细胞群的功能鉴定

基本信息
资源简介
后脑边界细胞的神经祖细胞/干细胞特性数据集
The neural-progenitor/stem-cell (NPSC) properties of hindbrain boundary cells
该数据集来自 NCBI GEO(GSE230804),研究鸡胚后脑边界细胞的神经祖细胞/干细胞特性。基于 CSPG 表达模式,用 FACS 分离 CSPG 阳性与阴性细胞,每组 4-6 个生物学重复(每个重复含 30 个后脑的细胞),进行 RNA 测序,用于基因表达谱分析和不同细胞群的功能鉴定。数据可用于比较两类细胞的转录组差异,探索后脑边界作为神经干细胞储库的潜力(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 27 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):18 HH 期鸡胚的后脑边界细胞表达 ECM 分子硫酸软骨素蛋白聚糖(CSPG)。为确定后脑边界的脑室区是否作为 NPSC 的储库,我们根据看似膜结合的 CSPG 表达模式,将后脑边界细胞与其余后脑细胞分开。采用 FACS 方法分离 CSPG 阳性细胞和 CSPG 阴性细胞。4-6 个生物学重复,每个重复由来自 30 个后脑的细胞组成,进行了 RNA 测序。这些 RNA 测序结果用于不同细胞群的基因表达谱分析和功能表征。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL32831、9031。本站分类:神经系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE230804
【使用注意】
· 源站最后修改于 Mar 13 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
18期HH鸡胚的后脑边界细胞表达ECM分子硫酸软骨素蛋白聚糖(CSPG)。为确定后脑边界的脑室区是否作为NPSCs的储存库,我们根据CSPG的表达模式(似为膜结合型)将后脑边界细胞与其余后脑细胞分离。采用FACS方法分离CSPG阳性细胞和CSPG阴性细胞。4-6个生物学重复,每个重复由30个后脑的细胞组成,进行了RNA测序。这些RNA测序结果用于不同细胞群的基因表达谱分析和功能表征。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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