GSE128615:X染色体基因Kdm6a调控CD4+ T细胞多个免疫应答基因并在自身免疫病中促病

多发性硬化(MS)是一种T细胞介导的自身免疫病,在疾病易感性上呈现性别二态模式。与许多自身免疫病一致,女性比男性更易患MS

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基因组分类多发性硬化CD4+ T细胞X染色体失活逃逸Kdm6a性别二态性自身免疫病组蛋白去甲基化酶
GSE128615: The X chromosome gene Kdm6a modulates multiple immune response genes in CD4+ T cells and is disease-promoting in autoimmune disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-23

资源简介

GSE128615:X染色体基因Kdm6a调控CD4+ T细胞多个免疫应答基因并在自身免疫病中促病

GSE128615 数据集围绕多发性硬化(MS)这一 T 细胞介导的自身免疫病展开,聚焦于疾病易感性中的性别二态现象。与许多自身免疫病一致,女性比男性更易患 MS,这种差异可能源于性激素、性染色体基因或两者共同作用。针对性染色体基因,少量 X 染色体基因能够逃逸 X 失活的剂量补偿机制,在女性(XX)中表达高于男性(XY)。高通量分析显示,在女性(对比男性)以及 XX 小鼠(对比 XY 小鼠)的 CD4+ T 细胞中,表达差异最显著的性别二态基因是 X 染色体上的组蛋白去甲基化酶与转录因子 Kdm6a;在 CD4+ T 细胞中特异性敲除 Kdm6a 可改善经典 CD4+ T 细胞介导的自身免疫病的临床疾病表现并减轻神经病理改变。该数据集即围绕上述研究内容组织,归属于神经系统疾病 / 其他分类,来源于 ncbi.nlm.nih.gov。

【数据集背景】

多发性硬化是一种 T 细胞介导的自身免疫疾病,在疾病易感性上呈现性别二态模式,女性比男性更易患病。这种性别差异的成因可能涉及性激素、性染色体基因或二者的共同作用。就性染色体基因而言,少数 X 染色体基因可逃逸 X 失活的剂量补偿机制,从而在女性(XX)中表达高于男性(XY)。该数据集对应的研究正是在这一背景下,考察 X 染色体基因在 CD4+ T 细胞中的作用及其对自身免疫病的影响。

【数据内容】

数据集英文名称为“GSE128615: The X chromosome gene Kdm6a modulates multiple immune response genes in CD4+ T cells and is disease-promoting in autoimmune disease”。从名称与源站描述可知,数据集涉及 X 染色体基因 Kdm6a 对 CD4+ T 细胞中多个免疫应答基因的调控,以及其在自身免疫病中的促病作用。高通量分析识别出 Kdm6a 是女性(对比男性)及 XX 小鼠(对比 XY 小鼠)CD4+ T 细胞中表达差异最显著的性别二态基因。关于样本数量、测序平台、数据文件类型与规模等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,本站分类为神经系统疾病 / 其他。源站描述提及研究使用了高通量分析,并涉及女性与男性、XX 与 XY 小鼠 CD4+ T 细胞的比较,以及在 CD4+ T 细胞中特异性敲除 Kdm6a 的实验观察。关于具体采集地点、时间、实验流程与样本处理细节,源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集适用于研究与多发性硬化相关的性别二态机制,特别是 X 染色体基因逃逸 X 失活后对 CD4+ T 细胞基因表达的调控;也适用于探讨 Kdm6a 作为组蛋白去甲基化酶与转录因子在 CD4+ T 细胞介导的自身免疫病中的作用,以及其在女性与男性、XX 与 XY 个体间表达差异的分析。其他具体应用场景源站未提供。

【使用方法】

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【质量与限制】

源站未提供。

【引用与许可】

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下载信息

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE128615

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

多发性硬化症(MS)是一种由T细胞介导的自身免疫性疾病,在疾病易感性上表现出性别二态性模式。与许多自身免疫性疾病一致,女性比男性更易患MS。性别二态性可能源于性激素、性染色体基因或两者的差异。就性染色体基因而言,一小部分X染色体基因逃避了X失活的剂量补偿机制,在女性(XX)中的表达高于男性(XY)。根据高通量分析,在来自女性(相较于男性)和XX小鼠(相较于XY)的CD4+ T细胞中表达更高的最显著性别二态性基因是Kdm6a,它是X染色体上的一种组蛋白去甲基化酶和转录因子。在CD4+ T细胞中特异性敲除Kdm6a可改善经典CD4+ T细胞介导的自身免疫性疾病——实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)的临床疾病并减少神经病理学改变。对Kdm6a特异性敲除的EAE小鼠CD4+ T细胞进行全转录组分析显示,Th2和Th1激活通路上调,神经炎症信号通路下调。

综上所述,这表明X染色体逃逸基因Kdm6a调控多个免疫反应基因,为自身免疫疾病易感性的性别差异提供了一种机制。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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