FOUNDCOG 婴儿清醒 fMRI 数据集

84 名 2 月龄婴儿的 172 个 5 分钟清醒 fMRI 会话,以及 42 名 9 月龄婴儿的 65 个 run。每个会话均包含反向相位编码的单频参考扫描,用于使用 FSL Topup 进行磁化率畸变校正

openneuro
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医学影像婴儿fMRI清醒成像神经系统OpenNeuro原始数据
FOUNDCOG

基本信息

模态
医学影像
许可
CC0
创建/更新时间
2026-10-18

资源简介

FOUNDCOG 婴儿清醒 fMRI 数据集

FOUNDCOG 是一个面向婴儿认知发展的公开神经影像数据集,本次发布为 v1 版本,汇集了在都柏林圣三一学院神经科学研究所完成 FOUNDCOG 图片任务的 2 月龄与 9 月龄婴儿的可共享数据。数据集包含 84 名 2 月龄婴儿的 172 个 5 分钟清醒 fMRI 会话,以及 42 名 9 月龄婴儿的 65 个 run;每个会话均配有反向相位编码的单频参考扫描,可用于基于 FSL Topup 的磁化率畸变校正。数据以 CC0 许可通过 OpenNeuro 平台开放,DOI 为 doi:10.18112/openneuro.ds006883.v1.0.1,发布时间为 2025 年 11 月 2 日,归属于神经系统疾病 / 其他分类。

【数据集背景】

FOUNDCOG 数据发布 v1 面向婴儿期认知功能与脑功能发育研究。源站说明指出,该发布收录的是完成 FOUNDCOG 图片任务的 2 月龄和 9 月龄婴儿中可共享的部分数据,采集工作在英国都柏林圣三一学院神经科学研究所完成。数据集以完全开放的互联网数据库形式向科学界与公众共享,其纳入范围受参与者监护人的知情同意与伦理批准条件约束。

【数据内容】

本次发布的核心内容是婴儿在清醒状态下观看 FOUNDCOG 图片任务时采集的功能磁共振数据。具体包括:84 名 2 月龄婴儿的 172 个 5 分钟清醒 fMRI 会话,以及 42 名 9 月龄婴儿的 65 个 run。每个会话均附带单频参考扫描,且参考扫描采用相反的相位编码方向,供 FSL Topup 进行磁化率畸变校正使用。源站描述在末尾提到参与者还完成了 videos 清醒 fMRI,但该句在源站描述中被截断,具体内容源站未提供。

【采集与来源】

数据采集对象为完成 FOUNDCOG 图片任务的 2 月龄与 9 月龄婴儿,采集地点为都柏林圣三一学院神经科学研究所。共享范围严格依据伦理审批与监护人同意:仅共享监护人明确同意“允许经伪匿名处理的数据,包括脑影像数据,通过互联网上的完全开放数据库与科学界及公众共享”的婴儿原始数据;根据研究的伦理批准,从新生儿重症监护病房(NICU)招募的参与者也被排除在这一完全开放数据库之外。数据通过 OpenNeuro 平台发布。

【适用场景】

该数据集适用于婴儿清醒态功能磁共振的方法学与发育神经科学研究,例如婴儿脑功能连接与自发活动的分析、婴儿 fMRI 预处理流程的建立与评估,以及基于反向相位编码参考扫描的磁化率畸变校正方法验证。由于数据以 CC0 许可完全开放,也可用于教学演示、分析流程复现与跨站点方法比较等用途。具体科学结论层面的适用性需结合数据自身特点判断,源站未提供相关说明。

【使用方法】

使用该数据集时,可依据每个会话附带的相反相位编码方向单频参考扫描,通过 FSL Topup 完成磁化率畸变校正,这是源站明确说明的配套处理信息。数据为原始数据形式共享,后续的预处理与分析步骤需使用者自行设计。数据获取渠道为 OpenNeuro,数据集标识为 ds006883,版本 v1.0.1。源站未提供其他使用说明。

【质量与限制】

该数据集仅包含监护人明确同意开放共享的婴儿原始数据,且按伦理批准排除了从 NICU 招募的参与者,因此共享样本并非全部采集样本,样本构成存在既定的纳入限制。2 月龄与 9 月龄两个年龄组的会话与 run 数量不同,使用时需注意两组数据规模不一致。源站未提供关于数据质量评分、伪影水平或缺失情况的进一步说明。

【引用与许可】

该数据集以 CC0 许可发布,使用者应通过 DOI doi:10.18112/openneuro.ds006883.v1.0.1 引用该数据发布。数据作者包括 Cliona O'Doherty、Áine T. Dineen、Anna Truzzi、Graham King、Enna-Louise D'Arcy、Jessica White、Tamrin Holloway、Chiara Caldinelli、Lorijn Zaadnoordijk、Anna Kravchenko、Ailbhe Tarrant、Angela T. Byrne、Adrienne F 等。发布时间为 2025 年 11 月 2 日。

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使用方式

数据集获取

源站:https://openneuro.org/datasets/ds006883

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

OpenNeuro dataset ds006883. BIDS-standardized neuroimaging dataset (MRI/EEG/MEG/PET).

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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