蜱虫叮咬后发热研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT03932448

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数据说明

条件：蜱叮咬；发热、蜱热、蜱传疾病、脑炎、蜱传、蜱叮咬。拟议研究由SU/萨尔格伦斯卡微生物学系与SU/东区传染病诊所合作开展，并联合瑞典各地多家传染病诊所，旨在利用现代诊断工具改进微生物学诊断检测方法，以实现对能够引起人类疾病的蜱传微生物（包括迄今尚未识别的病原体）的早期鉴定。在初次研究访视（第0天）时，将采集蜱叮咬后两周内出现发热的患者的血浆、血清、尿液、唾液和PBMC（以及蜱，如有）。此外，将在第9天和第30天后以及6个月后获取后续随访样本。

初始样本将采用以下方法进行分析：(a) 针对血浆、全血和尿液中的蜱传脑炎（TBE）、伯氏疏螺旋体、无形体、新埃立克体、立克次体、柯克斯体、土拉热和巴贝虫病的定向多重PCR分析，(b) TBE的常规IgM和IgG血清学检测，© “下一代测序”（NGS）用于检测细菌16s rRNA以及未知病毒，(d) 潜在生物标志物，以及(e) 宿主遗传因素。对于初始采样提示存在潜在病原体的患者或出现神经系统症状的患者，将进行腰椎穿刺并进一步分析脑脊液。样本还将就可能导致感染严重程度的潜在微生物学因素进行评估。

本研究的主要目标是改进蜱传病原体感染初期早期阶段的诊断工具，尤其是中枢神经系统受累前的TBE，并尝试确定哪些因素影响感染病程，因为据认为约75%的感染者在这一第一阶段痊愈，而其他人则发展为脑膜脑炎并伴有显著的后续神经系统后遗症。研究的次要目标包括调查p

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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