FALCON Benchmark M1-A:灵长类伸手抓握任务初级运动皮层记录

FALCON Benchmark M1-A 是一个聚焦于灵长类动物在伸手抓取任务中初级运动皮层神经活动的公开数据集,属于神经系统疾病相关领域

dandi
2024-03-18 更新
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时间序列分类神经系统疾病运动皮层灵长类reach-to-grasp神经生理NWBBRAIN Initiative
FALCON Benchmark M1-A: primary motor cortex recordings in primate during reach-to-grasp task

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2024-03-18
版本
0.241029.1405

资源简介

FALCON Benchmark M1-A:灵长类伸手抓握任务初级运动皮层记录

FALCON Benchmark M1-A 是一个聚焦于灵长类动物在伸手抓取任务中初级运动皮层神经活动的公开数据集,属于神经系统疾病相关领域。该数据集以 NWB 标准格式存储神经生理学记录,来源于 DANDI Archive(dandiset 000941),并作为 BRAIN Initiative 相关工作的组成部分对外发布。数据集主题涵盖神经系统疾病,可为运动皮层功能、感觉运动整合以及神经疾病机制等方向的研究提供基础数据资源。其命名中的“M1-A”指向初级运动皮层(primary motor cortex)的记录,而“reach-to-grasp”则表明行为范式围绕伸手抓取动作展开。整体而言,该数据集面向神经科学基础研究与神经系统疾病相关应用,提供标准化的神经电生理数据,便于研究者进行跨实验室的分析与比较。

【数据集背景】

该数据集来自 DANDI Archive,标识为 dandiset 000941,属于 BRAIN Initiative 框架下发布的神经生理学数据资源。其英文全称为 FALCON Benchmark M1-A: primary motor cortex recordings in primate during reach-to-grasp task,表明其属于 FALCON Benchmark 系列中的 M1-A 部分,研究对象为灵长类动物初级运动皮层,行为任务为伸手抓取。数据集在分类上归入神经系统疾病 / 其他类别,主题涵盖神经系统疾病。联系人为 Karpowicz, Brianna M.。源站未提供更多关于该基准系列整体设计、项目资助背景或研究机构的具体信息。

【数据内容】

该数据集的核心内容为灵长类动物在执行伸手抓取任务期间初级运动皮层的神经生理学记录。数据以 NWB(Neurodata Without Borders)标准格式存储,这一格式旨在促进神经生理学数据的标准化共享与互操作。源站描述中仅提及“NWB-standard neurophysiology dataset”,未提供具体的神经元数量、记录通道数、会话次数、动物个体数量、任务试次数量或行为学指标等细节。数据集主题涵盖神经系统疾病,但源站未说明其中是否包含疾病模型或正常对照的具体分组信息。除上述内容外,源站未提供关于数据文件中具体字段、电极阵列类型、信号采样率或预处理步骤的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源于 DANDI Archive,源站为 dandiarchive.org,dandiset 编号为 000941。采集对象为灵长类动物,采集区域为初级运动皮层,行为范式为伸手抓取任务。数据集被标注为 BRAIN Initiative 相关资源,联系人为 Karpowicz, Brianna M.。源站未提供具体的实验地点、动物物种、伦理审批信息、手术植入方法、记录设备型号或采集时间范围等细节。

【适用场景】

基于其主题与内容,该数据集适用于运动皮层神经活动分析、伸手抓取运动编码研究、神经生理信号解码以及神经系统疾病相关机制探索等方向。由于采用 NWB 标准格式,该数据集也适合用于跨数据集整合分析、算法基准测试以及神经数据处理工具的开发与验证。源站未提供关于该数据集具体适用任务、推荐分析流程或已验证应用案例的说明。

【使用方法】

该数据集以 NWB 标准格式发布,可通过 DANDI Archive 获取。使用者通常需要借助支持 NWB 格式的读取工具或相关神经数据分析库来加载和解析数据。源站未提供关于数据下载方式、文件组织结构、配套代码、使用教程或推荐软件环境的进一步说明。

【质量与限制】

该数据集为 BRAIN Initiative 相关资源,并采用 NWB 标准格式,这有助于提升数据的规范性与可复用性。然而,源站未提供关于数据完整性、信噪比、标注准确性、缺失数据情况或已知技术局限的具体信息。使用者在使用前应自行评估数据质量与适用性。此外,源站未提供关于该数据集是否存在伦理限制、使用范围限制或隐私相关约束的说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、DOI、许可协议或使用条款等具体信息。使用者如需引用或使用该数据集,应直接访问 DANDI Archive 上 dandiset 000941 的页面,以获取最新的引用与许可要求。联系人为 Karpowicz, Brianna M.,但源站未提供其所属机构或联系方式细节。

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使用方式

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源站:https://dandiarchive.org/dandiset/000941

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 000941. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Karpowicz, Brianna M.

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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