脑动静脉畸形中细胞间相互作用失调的定量蛋白质组学研究

脑动静脉畸形中细胞间相互作用失调:一项定量蛋白质组学研究[数据集]。主题标签:脑动静脉畸形、定量蛋白质组学、细胞间相互作用、神经系统疾病、PRIDE、PXD003289

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蛋白质回归脑动静脉畸形定量蛋白质组学细胞间相互作用神经系统疾病PRIDEPXD003289
Dysregulation of Cell-Cell Interaction in Brain Arteriovenous Malformations: A Quantitative Proteomics Study

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
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创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

脑动静脉畸形中细胞间相互作用失调的定量蛋白质组学研究

脑动静脉畸形是一种涉及脑内异常血管团结构的神经系统疾病,其形成与进展机制涉及复杂的细胞与分子层面改变。围绕这一主题,相关研究以定量蛋白质组学为手段,对脑动静脉畸形中细胞间相互作用的失调情况进行了系统考察,并形成了本数据集。该数据集英文名称为“Dysregulation of Cell-Cell Interaction in Brain Arteriovenous Malformations: A Quantitative Proteomics Study”,在来源站中登记为Wei Ge于2017年发布的数据集,来源站为ebi.ac.uk,对应PRIDE归档项目编号PXD003289。数据集主题标签涵盖脑动静脉畸形、定量蛋白质组学、细胞间相互作用、神经系统疾病、PRIDE以及PXD003289,本站分类归入神经系统疾病/其他。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

脑动静脉畸形属于神经系统疾病范畴,其核心特征之一是脑内血管结构异常。细胞间相互作用在维持组织稳态与血管功能中具有基础性作用,当这类相互作用发生失调时,可能参与疾病的发生与发展。该数据集以“脑动静脉畸形中细胞间相互作用失调”为研究主题,采用定量蛋白质组学策略,试图从蛋白质层面刻画与细胞间相互作用相关的改变。数据集来源于ebi.ac.uk,属于PRIDE归档项目,项目编号为PXD003289,发布者登记为Wei Ge,发布年份为2017年。该数据集被本站归入“神经系统疾病/其他”分类,并带有脑动静脉畸形、定量蛋白质组学、细胞间相互作用、神经系统疾病、PRIDE、PXD003289等主题标签。

【数据内容】

该数据集为一项定量蛋白质组学研究的数据集,主题聚焦于脑动静脉畸形中细胞间相互作用的失调。其英文名称明确指向“Dysregulation of Cell-Cell Interaction in Brain Arteriovenous Malformations: A Quantitative Proteomics Study”,说明数据集内容围绕脑动静脉畸形样本中的细胞间相互作用相关蛋白质展开,并采用定量蛋白质组学方法获得数据。数据集在来源站登记为数据集类型,来源站为ebi.ac.uk,对应PRIDE项目PXD003289。关于具体的样本数量、蛋白质鉴定数量、定量结果、差异表达蛋白列表、实验分组、质谱参数、原始数据文件构成等更细粒度的数据内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为ebi.ac.uk,源站描述中记录为:Wei Ge (2017). Dysregulation of Cell-Cell Interaction in Brain Arteriovenous Malformations: A Quantitative Proteomics Study [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003289。由此可知,数据集由Wei Ge于2017年发布,并通过PRIDE归档项目对外提供,项目编号为PXD003289。本站将其分类为神经系统疾病/其他,并标注了脑动静脉畸形、定量蛋白质组学、细胞间相互作用、神经系统疾病、PRIDE、PXD003289等主题标签。关于样本采集地点、伦理审批信息、样本处理流程、质谱仪器型号、色谱条件、数据采集软件等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与脑动静脉畸形及细胞间相互作用失调相关的研究场景,尤其适合作为定量蛋白质组学研究的参考数据。潜在使用方向包括:围绕脑动静脉畸形中细胞间相互作用相关蛋白质的鉴定与定量分析;对细胞间相互作用失调机制进行蛋白质层面的探索;将本数据集作为神经系统疾病蛋白质组学研究的对照或补充材料;在PRIDE项目PXD003289的框架下进行数据复用与方法学比较。此外,由于数据集带有脑动静脉畸形、定量蛋白质组学、细胞间相互作用、神经系统疾病等主题标签,也可用于相关主题的数据检索与整合。关于该数据集是否适用于临床诊断、药物靶点验证或特定实验流程的标准化参照,源站未提供。

【使用方法】

该数据集通过ebi.ac.uk来源站提供,对应PRIDE归档项目,项目编号为PXD003289。使用者可通过源站描述中给出的链接访问该项目页面,并依据PRIDE平台的一般使用方式获取数据集。关于该数据集的具体下载格式、文件组织方式、是否需要特定软件处理、是否提供分析脚本或参数说明、是否附带使用教程等,源站未提供。使用者在复用该数据集时,应结合PRIDE项目页面的实际说明进行操作,并遵循来源站的相关规定。

【质量与限制】

该数据集来源于ebi.ac.uk,登记为PRIDE项目PXD003289,发布者为Wei Ge,发布年份为2017年。其主题明确,围绕脑动静脉畸形中细胞间相互作用失调的定量蛋白质组学研究。然而,关于该数据集的质量评估指标、数据完整性、样本代表性、定量准确性、重复性、批次效应、缺失值情况、统计分析方法及验证结果等,源站未提供。此外,该数据集在本站被归入“神经系统疾病/其他”分类,具体分类依据与覆盖范围,源站未提供。使用者在解释与应用该数据集时,应充分考虑上述未提供信息所带来的限制。

【引用与许可】

该数据集的引用信息为:Wei Ge (2017). Dysregulation of Cell-Cell Interaction in Brain Arteriovenous Malformations: A Quantitative Proteomics Study [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003289。使用者在使用该数据集时,应按照来源站要求进行引用,并注明PRIDE项目编号PXD003289。关于该数据集的许可协议、使用条款、是否允许商业用途、是否允许再分发等具体许可信息,源站未提供。

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源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003289

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Wei Ge (2017). Dysregulation of Cell-Cell Interaction in Brain Arteriovenous Malformations: A Quantitative Proteomics Study [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD003289

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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