CSF1R单倍体不足雌性小鼠纵向研究的扩散磁共振指标(FA、MD、NDI、ODI):Schmidt等(Neurobiology of Disease)补充数据集

该数据集为CSF1R单倍剂量不足(Csf1r+/−)ALSP小鼠模型纵向研究的补充数据,包含DICOM格式的原始扩散MRI图像,并涉及FA、MD、NDI、ODI等扩散指标

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2026-10-05 更新
浏览 11
医学影像回归diffusion MRIDWI-NODDIfractional anisotropymean diffusivityneurite density indexorientation dispersion index
Diffusion MRI metrics (FA, MD, NDI, ODI) from a longitudinal study of CSF1R-haploinsufficient female mice: supplementary dataset for Schmidt et al. (Neurobiology of Disease)

基本信息

模态
医学影像
大小
1.255436702 GB
任务类型
回归
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-05

资源简介

CSF1R单倍体不足雌性小鼠纵向研究的扩散磁共振指标(FA、MD、NDI、ODI):Schmidt等(Neurobiology of Disease)补充数据集

Diffusion MRI metrics (FA, MD, NDI, ODI) from a longitudinal study of CSF1R-haploinsufficient female mice: supplementary dataset for Schmidt et al. (Neurobiology of Disease)

该数据集为CSF1R单倍剂量不足(Csf1r+/−)ALSP小鼠模型纵向研究的补充数据,包含DICOM格式的原始扩散MRI图像,并涉及FA、MD、NDI、ODI等扩散指标。数据来自14只雌性动物,分为Csf1r+/−与WT两组(各7只),扫描年龄约12至16个月,全部纳入最终发表分析。图像采集于University of Western Ontario的CFMM,使用9.4T Agilent/Bruker BioSpec Avance III扫描仪。该数据可用于神经影像表型分析、白质微结构评估及疾病模型相关的扩散指标研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含以DICOM格式采集的原始扩散MRI图像,采集工作是表征CSF1R单倍剂量不足(Csf1r+/−)小鼠模型神经影像表型研究的一部分,该模型用于研究成人起病型伴轴突球样体和色素胶质细胞的白质脑病(ALSP),详见Schmidt等(Neurobiology of Disease, NBD-26-2039)。图像采集于Centre for Functional and Metabolic Mapping(CFMM),该机构是位于加拿大安大略省伦敦市University of Western Ontario的Robarts Research Institute大楼内的Western核心研究设施,使用9.4-tesla扫描仪(Agilent/Bruker BioSpec Avance III)。该存储库仅包含雌性动物的数据。共采集了14只雌性动物的扫描数据,分为两个实验组(Csf1r+/−和WT);扫描时年龄:约12-16个月。所有14只动物均纳入最终发表分析(n=7 WT,n=7 Csf1r+/−)。Diffusion

【主题与分类】

主题标签:diffusion MRI、DWI-NODDI、fractional anisotropy、mean diffusivity、neurite density index、orientation dispersion index。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.23129686

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.26 GB。

数据说明

本数据集包含以DICOM格式存储的原始扩散MRI图像,这些图像是一项研究的一部分,该研究旨在表征CSF1R单倍体不足(Csf1r+/−)小鼠模型(用于研究成人起病的轴突球样变和色素胶质细胞脑白质病,ALSP)的神经影像表型,详见Schmidt等人(Neurobiology of Disease, NBD-26-2039)。图像采集于功能与代谢映射中心(CFMM),该中心是西安大略大学罗巴茨研究所大楼内的西部核心研究设施,位于加拿大安大略省伦敦市,使用9.4特斯拉扫描仪(Agilent/Bruker BioSpec Avance III)。本存储库仅包含雌性动物的数据。共采集了14只雌性动物的扫描图像,分为两个实验组(Csf1r+/−和WT);扫描时年龄:约12-16个月。所有14只动物均纳入最终发表的分析(n=7 WT,n=7 Csf1r+/−)。扩散指标(FA、MD、NDI和ODI)使用FSL和NODDI Matlab工具箱从这些图像中导出。随附的README提供了采集参数、动物元数据(性别、年龄和基因型)以及所用工具,使原始数据能够独立重新处理。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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