1P与2P荧光的深度依赖性

该数据集属于神经系统疾病领域,采用 NWB 标准组织神经生理学数据,与 BRAIN Initiative 相关。数据集的联系人为 Cohen, Adam E.

dandi
2024-05-16 更新
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时间序列神经系统疾病神经生理NWBBRAIN Initiative荧光成像DANDI
Depth dependence of 1P and 2P fluorescence

基本信息

模态
时间序列
创建/更新时间
2024-05-16
版本
draft

资源简介

1P与2P荧光的深度依赖性

Depth dependence of 1P and 2P fluorescence 是一个公开的神经生理学数据集,收录于 DANDI Archive,编号为 dandiset 001029。该数据集属于神经系统疾病领域,采用 NWB 标准组织神经生理学数据,与 BRAIN Initiative 相关。数据集的联系人为 Cohen, Adam E.。从主题上看,该数据集涵盖神经系统疾病方向,可为相关研究提供公开的数据资源。整体而言,该数据集面向神经科学和神经系统疾病研究社区,以标准化格式提供神经生理学记录,便于研究者获取、分析并用于方法学探索与疾病机制研究。

【数据集背景】

该数据集来源于 DANDI Archive,属于 BRAIN Initiative 相关数据资源,采用 NWB 标准存储神经生理学数据。其英文名称为 Depth dependence of 1P and 2P fluorescence,提示其内容与单光子(1P)和双光子(2P)荧光信号的深度依赖性有关。数据集被归类于神经系统疾病领域,联系人为 Cohen, Adam E.。关于该数据集的具体研究背景、所属项目细节及科学问题,源站未提供。

【数据内容】

该数据集为 NWB 标准的神经生理学数据集,主题涵盖神经系统疾病。其名称涉及 1P 和 2P 荧光及其深度依赖性,表明数据可能包含与荧光成像相关的神经生理学记录。除上述信息外,关于数据的具体模态、通道、采样率、记录区域、受试者数量、实验条件及文件结构等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来自 dandiarchive.org,为 DANDI Archive 上的 dandiset 001029。源站描述其为 NWB-standard neurophysiology dataset(BRAIN Initiative),联系人为 Cohen, Adam E.。关于采集设备、实验动物、手术方法、成像参数、采集地点及具体实验流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集属于神经系统疾病领域的公开神经生理学数据,可用于神经科学相关研究中的数据分析、方法验证或探索性研究。由于采用 NWB 标准,便于与支持该格式的工具和流程配合使用。关于该数据集具体适用的研究问题、分析任务或应用方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过 DANDI Archive 获取,标识为 dandiset 001029。使用者可依据 DANDI Archive 的常规访问方式获取数据,并利用支持 NWB 标准的工具进行读取和处理。关于具体的下载步骤、访问权限、所需软件版本及处理流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 DANDI Archive 上的公开数据集,采用 NWB 标准。关于数据质量、完整性、潜在偏差、使用限制及已知问题,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的联系人为 Cohen, Adam E.。关于引用格式、许可条款及使用条件,源站未提供。

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源站:https://dandiarchive.org/dandiset/001029

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DANDI Archive dandiset 001029. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Cohen, Adam E…

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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