Mowat-Wilson综合征患者来源GABA能中间神经元基因表达数据

资源简介

Mowat-Wilson综合征患者来源GABA能中间神经元基因表达数据

Data: Gene expression of Mowat-Wilson syndrome patient derived GABAergic interneurons

该数据集来自figshare.scilifelab.se，包含Mowat-Wilson综合征患者及健康供体来源iPSC向神经谱系分化的批量RNA测序基因计数数据。样本覆盖IPS、INT（D10）和D65三个时间点，涉及两对同胞患者与两名健康对照的iPSC系。计数数据未标准化，可使用DESeq2进行分析，适用于研究Mowat-Wilson综合征相关的基因表达变化及皮质分化过程（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。

【数据集背景】

项目资助方：Hjärnfonden (FO2019-0210 and FO2020-0171)。源站首次发布：2022-08-12。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：从同胞（MW1=26，MW2=27）和两名健康供体（Ctl2=K02和Ctl8=K08）的成纤维细胞建立了iPSC系。如所述使用Dual-SMAD抑制进行iPSC的神经皮质分化，促进转化为神经干细胞（NSC）10天（样本INT），随后定向分化为皮质谱系65天（样本D65）。批量RNA测序读段比对到ENSEMBL人类参考基因组（Homo_sapiens.GRCh37.75），并使用STAR读段比对器生成基因计数。计数数据未标准化，可与DESEq2一起使用。为所有三个时间点IPS -> INT（D10）-> D65生成了表达数据。文件名为：timepoint_SampleReadsPerGene.out.tab

【数据结构与技术规格】

文件数 14 个，合计 16.22 MB。数据集 DOI：10.17044/scilifelab.20472144.v1。

【主题与分类】

源站学科分类：Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)。主题标签：DESeq2、iPSC、Gene expression。本站分类：神经系统疾病。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Gene expression (incl. microarray and other genome-wide approaches)。

【获取与许可】

源站页面：https://figshare.scilifelab.se/articles/dataset/Data_Gene_expression_of_Mowat-Wilson_syndrome_patient_derived_GABAergic_interneurons/20472144

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Klar, Joakim; Dahl, Niklas; Schuster, Jens (2022). Data: Gene expression of Mowat-Wilson syndrome patient derived GABAergic interneurons. Uppsala University. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2025-01-16，引用时请注意版本时效。