人类分泌蛋白编码基因及其系统发育年龄与表达特性汇编

该数据集汇编了人类分泌蛋白编码基因、其系统发育年龄及部分表达特性,用于分析脊椎动物进化过程中不同分泌蛋白组与进化过渡组合是否经历相似的新基因获得模式

dataone
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基因组Evolutionary biologyComparative genomicsMale infertilityVertebrates
Compilation of human secretome-encoding genes, their phylogenetic age, and some of their expression properties.

基本信息

模态
基因组
创建/更新时间
2026-10-17

资源简介

人类分泌蛋白编码基因及其系统发育年龄与表达特性汇编

Compilation of human secretome-encoding genes, their phylogenetic age, and some of their expression properties.

该数据集汇编了人类分泌蛋白编码基因、其系统发育年龄及部分表达特性,用于分析脊椎动物进化过程中不同分泌蛋白组与进化过渡组合是否经历相似的新基因获得模式。研究发现,在真兽类辐射期间,男性生殖分泌蛋白组获得的新基因最多,且这些新基因多优先表达于附睾。数据可无限制使用,适用于进化生物学与比较基因组学研究(来源 DataONE)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集汇编了人类分泌蛋白编码基因、其系统发育年龄及部分表达特性。这些信息用于确定所有分泌蛋白组与进化过渡组合在脊椎动物进化过程中是否经历了相似的新基因获得。我们发现,与其他任何分泌蛋白组与进化过渡组合相比,男性生殖分泌蛋白组在真兽类辐射期间获得的新基因最多。这些新基因大多优先表达于附睾,表明该器官是男性生殖道中经历最大重构的器官。这些数据可无限制使用。分泌蛋白编码基因从 Human Proteome Atlas( Chen 等人报道的不同年龄类别匹配。

【主题与分类】

主题标签:Evolutionary biology、Comparative genomics、Male infertility、Vertebrates。本站分类:神经系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A199e0e0da578249282f1fa35b3d7dc1f87b6b0c86098e228381decbd2d5e5db4

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集汇编了人类分泌组编码基因、其系统发育年龄及其部分表达特性。这些信息用于确定在脊椎动物进化过程中,所有分泌组与进化过渡的组合是否经历了相似的新基因获得。我们发现,与其他任何分泌组与进化过渡的组合相比,雄性生殖分泌组在真兽类辐射期间经历了最大规模的新基因增加。这些新基因大多优先在附睾中表达,表明附睾是雄性生殖道中重构程度最大的器官。这些数据可不受限制地使用。,分泌组编码基因从Human Proteome Atlas(https://www.proteinatlas.org/)获取,并与Chen等人2025年报道的不同年龄类别相匹配(Chen et al. 2025; DOI: 10.1101/2023.11.14.567139)。,# 人类分泌组编码基因、其系统发育年龄及其部分表达特性的汇编。

数据集DOI:10.5061/dryad.pvmcvdp0s ## 数据及文件结构说明 文件Dataset_EV1.csv中的数据来源于目前在分子水平上特征描述最为全面的人类分泌组集合(Uhlen等,2019;DOI:10.1126/scisignal.aaz027)。人类分泌组包含2,520个基因,这些基因根据亚细胞定位、信号肽的存在以及跨膜结构域的缺失被预测为编码分泌蛋白。这些分泌蛋白根据其在人体内的产生部位被划分为九个不同的分泌组:血液、脑、消化系统、女性生殖(FR)系统、男性生殖(MR)系统、免疫球蛋白、细胞内及膜蛋白(作为对照)、细胞外基质以及其他组织。此外,还设置了一个未知定位的额外类别,用于收录……

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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