IV型胶原α-1链降解组基础图谱

数据集获取

源站：https://doi.org/10.5522/04/33950749.v1

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数据说明

本Figshare存储库收录了胶原蛋白α-1(IV)链降解组基础图谱（第1版），这是通过对人胶原蛋白α-1(IV)链（COL4A1，UniProt：P02462）进行蛋白水解切割所生成的理论肽段景观的全面计算机模拟重建。该数据集专为蛋白质组学、降解组学、质谱分析、细胞外基质生物学、血管生物学及生物标志物发现领域的研究人员设计，作为开放获取的参考资源，系统性地绘制了IV型胶原蛋白的潜在片段图谱。该图谱并非将COL4A1视为单一静态结构蛋白，而是采用以降解组为中心的视角，其中基底膜周转、细胞外基质重塑和酶促切割生成动态的胶原蛋白衍生肽段群体。IV型胶原蛋白是基底膜的主要结构成分，形成特化的细胞外基质网络，提供机械支撑、组织构造和细胞-基质信号传导。

COL4A1在多种组织中表达，在血管基底膜中尤为重要，包括与脑、肾及其他器官相关的基底膜。COL4A1的遗传改变与一系列遗传性小血管和基底膜疾病相关，包括脑小血管病及相关神经表型。因此，表征COL4A1的蛋白水解片段图谱可能为基底膜重塑、血管完整性、组织损伤、神经血管病理学以及基于肽的生物标志物开发提供有价值的见解。蛋白质组学数据集的关键特征利用预测的酶切和化学切割位点，该图谱系统性地生成并注释可能的COL4A1肽段片段。每个片段均使用与质谱、蛋白质组学和计算肽分析相关的理化特征进行表征。质谱与肽

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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