人类皮层基因表达与葡萄糖利用关系研究数据

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A94437b87428b838d7a55cc929dc51f916ae89dcf884b6e18550ffa11f71a0a93

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

目的：人脑发育遵循一种独特模式，其特征是出生后经历长时间的生长发育与重组，以及葡萄糖利用率在出生后达到峰值。这些发育变化背后的分子过程尚不明确。本研究旨在确定基因表达的发育轨迹，并考察随年龄差异表达的基因的进化历史。方法：我们采用微阵列技术，测定从婴儿期到成年期的人大脑皮层样本中mRNA表达的年龄相关模式。与以往依赖尸检组织的人新皮层发育基因表达研究不同，我们检测的是手术切除组织无病变边缘的mRNA表达。我们使用回归模型来识别表达随年龄呈显著线性或曲线函数的转录本，并运用群体遗传学方法考察这些基因的进化。结果：我们鉴定出40个表达具有显著年龄相关轨迹的转录本。

十个基因在神经系统发育和能量代谢中已有明确作用，其他则是大脑发育中的新候选基因。十六个转录本表现出相似的表达模式，其特征是在儿童期表达下降。比较基因组分析显示，三个基因的调控区域有证据表明在近期人类进化中经历了适应性进化。结论：这些发现提供了证据，表明人类大脑皮层中表达的一部分基因广泛反映了皮层葡萄糖消耗的发育模式。基因表达与葡萄糖利用之间是否存在因果关系仍有待确定。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。