弥漫性大B细胞淋巴瘤数据集(3类)

该数据集是一个基于基因表达谱的弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)数据集,包含三类淋巴瘤亚型的样本数据,数据模态为基因表达谱(数值型表格)。其主要用途是支持癌症研究,特别是用于淋巴瘤亚型分类、生物标志物识别以及机器学习模型在癌症诊断和预后预测中的开发与验证。

OpenMLOpenML
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2023-02-17 更新
浏览 32
分类BiotechnologyHealthLife ScienceMedicinemicroarray
Lymphoma-3

基本信息

任务类型
分类
许可
Public
创建/更新时间
2023-02-17
版本
v1

资源简介

弥漫性大B细胞淋巴瘤数据集(3类)

【一句话概览】

该数据集为弥漫性大B细胞淋巴瘤(Lymphoma 3 classes,DLBCL)数据集,作者包括A. Alizadeh、M. Eisen、R. Davis、C. Ma、I. Lossos、A. Rosenwald、J. Boldrick、H. Sabet、T. Tran、X. Yu等人,引用来源为Nature 403 (6769) (2000) 503-511发表的《Distinct types of diffuse large b-cell lymphoma identified by gene expression profiling》。数据集含1个文件,合计大小1.5 MB,标签涵盖Biotechnology、Health、。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Lymphoma-3》。源站首次发布:2023-02-17。

【数据内容】

源站原始描述:**Diffuse large b-cell lymphoma (Lymphoma 3 classes, DLBCL) dataset** **Authors**: A. Alizadeh, M. Eisen, R. Davis, C. Ma, I. Lossos, A. Rosenwald, J. Boldrick, H. Sabet, T. Tran, X. Yu, et al **Please cite**: (URL A. Alizadeh, M. Eisen, R. Davis, C. Ma, I. Lossos, A. Rosenwald, J. Boldrick, H. Sabet, T. Tran, X. Yu, et al, Distinct types of diffuse large b-cell lymphoma identified by gene expression profiling, Nature 403 (6769) (2000) 503-511

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):**弥漫性大B细胞淋巴瘤(淋巴瘤3类,DLBCL)数据集** **作者**:A. Alizadeh、M. Eisen、R. Davis、C. Ma、I. Lossos、A. Rosenwald、J. Boldrick、H. Sabet、T. Tran、X. Yu等 **请引用**:(URL):A. Alizadeh、M. Eisen、R. Davis、C. Ma、I. Lossos、A. Rosenwald、J. Boldrick、H. Sabet、T. Tran、X. Yu等,通过基因表达谱鉴定弥漫性大B细胞淋巴瘤的不同类型,Nature 403 (6769) (2000) 503-511

主表 Lymphoma-3.arff 含 2 列、样本前 1999 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 1.49 MB。

【主题与分类】

主题标签:Biotechnology、Health、Life Science、Medicine、microarray。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.openml.org/d/45094

使用许可:Public。

规范引用:A. Alizadeh, M. Eisen, R. Davis, C. Ma, I. Lossos, A. Rosenwald, J. Boldrick, H. Sabet, T. Tran, X. Yu, et al, Distinct types of diffuse large b-cell lymphoma identified by gene expression profiling, Nature 403 (6769) (2000) 503-511

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使用方式

数据集获取

源站:https://www.openml.org/search?type=data&sort=runs&status=active&id=45094

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个专注于弥漫性大B细胞淋巴瘤(DLBCL)的基因表达谱数据集,包含三类淋巴瘤亚型的样本。数据来源于Alizadeh、Eisen、Davis等研究者的工作,通过基因表达谱技术构建,旨在识别和区分DLBCL的不同分子亚型。该数据集主要用于癌症生物标志物发现、淋巴瘤亚型分类、基因表达模式分析以及机器学习在癌症诊断与预后预测中的应用研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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