弥漫性大B细胞淋巴瘤-11类

该数据集是一个基于基因表达谱的医学数据集,主要包含弥漫性大B细胞淋巴瘤样本的基因表达数据,数据模态为基因表达谱(如微阵列数据),主要用于癌症研究、分子分型分析、生物信息学探索以及疾病诊断和个性化治疗策略的开发,帮助识别DLBCL的不同亚型并揭示其分子机制。

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2023-02-17 更新
浏览 41
分类BiotechnologyHealthLife ScienceMedicinemicroarray
Lymphoma-11

基本信息

任务类型
分类
许可
Public
创建/更新时间
2023-02-17
版本
v1

资源简介

弥漫性大B细胞淋巴瘤-11类

【一句话概览】

Lymphoma-11 为弥漫性大 B 细胞淋巴瘤数据集,由 A. Alizadeh、M. Eisen、R. Davis、C. Ma、I. Lossos、A. Rosenwald、J. Boldrick、H. Sabet、T. Tran、X. Yu 等人提供。相关成果发表于 Nature 403 (6769) (2000) 503-511,题为 Distinct types of diffuse large b-cell lymphoma identified by gene expression profiling。数据集含 1 个文件,合计 2.1 MB,标签包括 Biotechnology、Health、Life Scienc。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Lymphoma-11》。源站首次发布:2023-02-17。

【数据内容】

源站原始描述:**Diffuse large b-cell lymphoma (Lymphoma 11 classes, DLBCL) dataset** **Authors**: A. Alizadeh, M. Eisen, R. Davis, C. Ma, I. Lossos, A. Rosenwald, J. Boldrick, H. Sabet, T. Tran, X. Yu, et al **Please cite**: (URL A. Alizadeh, M. Eisen, R. Davis, C. Ma, I. Lossos, A. Rosenwald, J. Boldrick, H. Sabet, T. Tran, X. Yu, et al, Distinct types of diffuse large b-cell lymphoma identified by gene expression profiling, Nature 403 (6769) (2000) 503-511

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):**弥漫性大B细胞淋巴瘤(淋巴瘤11类,DLBCL)数据集** **作者**:A. Alizadeh、M. Eisen、R. Davis、C. Ma、I. Lossos、A. Rosenwald、J. Boldrick、H. Sabet、T. Tran、X. Yu等 **请引用**:(URL):A. Alizadeh、M. Eisen、R. Davis、C. Ma、I. Lossos、A. Rosenwald、J. Boldrick、H. Sabet、T. Tran、X. Yu等,通过基因表达谱鉴定弥漫性大B细胞淋巴瘤的不同类型,Nature 403(6769)(2000)503-511

主表 Lymphoma-11.arff 含 2 列、样本前 1999 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 2.12 MB。

【主题与分类】

主题标签:Biotechnology、Health、Life Science、Medicine、microarray。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://www.openml.org/d/45096

使用许可:Public。

规范引用:A. Alizadeh, M. Eisen, R. Davis, C. Ma, I. Lossos, A. Rosenwald, J. Boldrick, H. Sabet, T. Tran, X. Yu, et al, Distinct types of diffuse large b-cell lymphoma identified by gene expression profiling, Nature 403 (6769) (2000) 503-511

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使用方式

数据集获取

源站:https://www.openml.org/search?type=data&sort=runs&status=active&id=45096

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

弥漫性大B细胞淋巴瘤(Lymphoma 11 classes, DLBCL)数据集是一个用于癌症研究的基因表达谱数据集,由Alizadeh、Eisen、Davis等研究人员构建。该数据集包含通过基因表达谱技术(如微阵列)收集的弥漫性大B细胞淋巴瘤样本的基因表达数据,旨在识别和分类DLBCL的不同亚型。数据来源为公开的医学研究,主要应用于生物信息学、癌症分子分型、基因表达分析和疾病诊断研究,帮助研究人员理解淋巴瘤的分子机制并开发个性化治疗策略。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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