全脑c-Fos免疫染色光片成像的PACAP敲除与对照小鼠分析
主题标签：神经系统疾病、PACAP、c-Fos、光片成像、全脑成像、免疫染色、NWB、DANDI。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集，主题涵盖神经系统疾病。
基本信息
资源简介
全脑c-Fos免疫染色光片成像的PACAP敲除与对照小鼠分析
CATNIP Analysis of light sheet imaging of whole-brain c-Fos immunostaining in constitutive PACAP-knockout and control PACAP-flox/flox mice 是一个公开的神经科学数据集，收录于 DANDI Archive，编号为 dandiset 001362。该数据集围绕神经系统疾病主题，采用光片成像技术对全脑 c-Fos 免疫染色结果进行采集与分析，研究对象包括组成型 PACAP 基因敲除小鼠与对照 PACAP-flox/flox 小鼠。数据以 NWB 标准格式组织，属于 BRAIN Initiative 支持的神经生理学数据资源，联系人为 Eiden, Lee。本站将其归类于神经系统疾病 / 其他方向，主题标签涵盖神经系统疾病、PACAP、c-Fos、光片成像、全脑成像、免疫染色、NWB 与 DANDI。整体而言，该数据集为研究 PACAP 相关神经功能与全脑活动模式提供了公开可用的影像与神经生理数据基础。
【数据集背景】
该数据集来自 DANDI Archive，源站描述其为 dandiset 001362，属于 NWB 标准的神经生理学数据集，并受 BRAIN Initiative 支持。数据集聚焦于神经系统疾病领域，以 PACAP 基因敲除小鼠与对照小鼠为对象，结合全脑 c-Fos 免疫染色与光片成像，用于观察全脑范围内与 PACAP 相关的神经活动标记分布。PACAP 与 c-Fos 均为神经生物学研究中常见的关注对象，前者与神经肽信号相关，后者常作为神经元活动的间接指标。该数据集将基因型差异与全脑成像分析结合，属于神经系统疾病方向下的公开数据资源。联系人为 Eiden, Lee。除上述信息外，源站未提供更详细的研究背景说明。
【数据内容】
数据内容涉及对组成型 PACAP 敲除小鼠与对照 PACAP-flox/flox 小鼠的全脑 c-Fos 免疫染色进行光片成像，并包含名为 CATNIP 的分析。数据以 NWB 标准格式组织，属于神经生理学数据集。主题标签包括神经系统疾病、PACAP、c-Fos、光片成像、全脑成像、免疫染色、NWB 与 DANDI。关于具体样本数量、图像分辨率、通道设置、脑区划分、分析指标或统计结果，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 dandiarchive.org，源站描述为 DANDI Archive dandiset 001362，属于 NWB 标准的神经生理学数据集，并受 BRAIN Initiative 支持。联系人信息为 Eiden, Lee。数据采集涉及光片成像与全脑 c-Fos 免疫染色，研究对象为组成型 PACAP 敲除小鼠与对照 PACAP-flox/flox 小鼠。关于具体采集设备、成像参数、染色流程、实验地点或时间范围，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于神经系统疾病相关研究，尤其是涉及 PACAP 信号、c-Fos 活动标记、全脑成像与光片成像分析的方向。由于数据以 NWB 标准组织，可用于神经生理学数据的标准化处理、跨研究比较或再分析。其主题标签涵盖神经系统疾病、PACAP、c-Fos、光片成像、全脑成像、免疫染色、NWB 与 DANDI，因此适合对这些主题感兴趣的科研人员使用。关于具体适用疾病模型、分析流程或验证用途，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 DANDI Archive 获取，源站标识为 dandiset 001362。数据以 NWB 标准格式提供，使用者可依据 NWB 生态中的常见工具进行读取与处理。由于数据集涉及光片成像与全脑 c-Fos 免疫染色分析，使用时可结合神经影像与神经生理数据分析流程。关于具体下载方式、访问权限、推荐软件版本或分析步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 DANDI Archive 公开数据集，编号 dandiset 001362，属于 NWB 标准的神经生理学数据集，并受 BRAIN Initiative 支持。其主题标签涵盖神经系统疾病、PACAP、c-Fos、光片成像、全脑成像、免疫染色、NWB 与 DANDI。关于数据质量评估、缺失情况、批次效应、样本量、重复性验证或使用限制，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集来源于 dandiarchive.org，源站描述为 DANDI Archive dandiset 001362，联系人信息为 Eiden, Lee。关于具体引用格式、作者列表、许可协议或使用条款，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://dandiarchive.org/dandiset/001362
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DANDI Archive dandiset 001362. NWB-standard neurophysiology dataset (BRAIN Initiative). Contact: Eiden, Lee.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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