孤立型与综合征型视神经病变患者数据集:关联RTN4IP1基因变异

该数据集围绕RTN4IP1基因变异相关的孤立型与综合征型视神经病变,汇集了文献中可获取的全部临床病例,并补充了本中心诊断的未发表患者,采用标准命名描述分子与表型特征

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2026-02-16 更新
浏览 18
基因组分类RTN4IP1Reticulon 4 interacting protein 1mitochondrianeurodegenerative disordersoptic atrophyoptic neuropathyoptic atrophy 10OPA10
A dataset of patients with isolated and syndromic optic neuropathies linked to <i>RTN4IP1</i> genetic variants

基本信息

模态
基因组
大小
0.010315527 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-02-16
版本
v4

资源简介

孤立型与综合征型视神经病变患者数据集:关联RTN4IP1基因变异

A dataset of patients with isolated and syndromic optic neuropathies linked to RTN4IP1 genetic variants

该数据集围绕RTN4IP1基因变异相关的孤立型与综合征型视神经病变,汇集了文献中可获取的全部临床病例,并补充了本中心诊断的未发表患者,采用标准命名描述分子与表型特征。数据包含7个文件,涵盖患者临床数据、HPO本体文件、LOVD下载数据及R绘图脚本。通过计算推理进行综合分析,提供致病变异的更新遗传图谱及表型异常的本体注释网格,可用于遗传性视神经病变的基因型-表型关联研究与临床异质性分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026-02-16。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Reticulon 4 interacting protein 1(RTN4IP1)基因的双等位致病性变异可导致视神经萎缩,可为孤立型或伴有共济失调、智力障碍和癫痫发作。在20岁前确诊的遗传性视神经病变患者中,7%被确定由该基因变异引起。我们通过整理文献中所有可获取的临床病例,并加入本中心诊断的未发表患者,使用标准命名法描述分子和表型特征,构建了该基因的数据集。我们基于计算推理进行了全面的数据分析,以提供数据集的整体概况并验证其相关性。该新数据集提供了已报道致病性变异的更新遗传图谱,以及以网格形式展示临床异质性的表型异常本体注释。

【数据结构与技术规格】

文件数 7 个,合计 10.32 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.26243021.v4。

【主题与分类】

源站学科分类:Molecular medicine、Ophthalmology、Neurogenetics。主题标签:RTN4IP1、Reticulon 4 interacting protein 1、mitochondria、neurodegenerative disorders、optic atrophy、optic neuropathy、optic atrophy 10、OPA10。本站分类:神经系统疾病/其他。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Molecular medicine、Ophthalmology、Neurogenetics。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/A_dataset_of_patients_with_isolated_and_syndromic_optic_neuropathies_linked_to_i_RTN4IP1_i_genetic_variants/26243021

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Ferré, Marc (2024). A dataset of patients with isolated and syndromic optic neuropathies linked to RTN4IP1 genetic variants. figshare. Dataset

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源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.26243021.v4

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 10.3 MB。

数据说明

Reticulon 4 interacting protein 1 (RTN4IP1)基因的双等位基因致病变异可导致视神经萎缩,既可为孤立性,也可伴有共济失调、智力障碍和癫痫发作。在20岁前确诊的患者中,7%被确定该基因为遗传性视神经病变的病因。我们通过整理文献中所有可获得的临床病例,并加入本中心诊断的未发表患者,构建了该基因的数据集,采用标准命名法描述分子和表型特征。我们基于计算推理进行了全面的数据分析,以提供数据集的整体概况并验证其相关性。这一新数据集提供了已报道致病变异的更新遗传图谱、以网格形式展示临床异质性的表型异常本体注释,以及与其他遗传性视神经病变数据库的完全互操作性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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