重症肌无力（MG）与非重症肌无力患者的ASV表
该数据集包含重症肌无力患者与非患者的肠道微生物组扩增子序列变体（ASV）表格，数据模态为微生物组学基因序列数据，通过机器学习方法识别出31个高重要性ASV，其中毛螺菌科和瘤胃菌科细菌的丰度差异显著，主要用于重症肌无力的微生物标志物发现、机器学习辅助诊断模型构建及疾病病理机制的相关性研究。
基本信息
资源简介
重症肌无力（MG）与非重症肌无力患者的ASV表
【数据集背景】
本数据集源站标题为《ASV tables of Myasthenia gravis (MG) and non-Myasthenia gravis》。源站首次发布：2023-09-22。
【数据内容】
源站原始描述：Myasthenia gravis (MG) is a neuromuscular junction disease with a complex pathophysiology and clinical variation for which no clear biomarker has been discovered. We hypothesized that because changes in gut microbiome composition often occur in autoimmune diseases, the gut microbiome structures of patients with MG would differ from those without, and supervised machine learning (ML) analysis strategy could be trained using data from gut microbiota for diagnostic screening of MG. Genomic DNA from…
文件 README.md 为文本内容，开头为：ASV tables of MG and non-MG - In this study, stool samples were collected from 19 individuals with MG and 10 individuals without MG, immediately frozen, an…
文件 asv_reps.fasta 为文本内容，开头为：>ASV_1 CAGTGAGGAATATTGGTCAATGGGCGAGAGCCTGAACCAGCCAAGTAGCGTGAAGGATGACTGCCCTATGGGTTGTAAACTTCTTTTATAAAGGAATAAAGTCGGGTATGGATACCCGTTTGCATGTACTTTATGAATAAGGATCGGCTAAC…
【数据结构与技术规格】
文件数 2 个，合计 665.15 KB。数据集 DOI：10.5061/dryad.73n5tb32m。
【主题与分类】
主题标签：ASV table、microbiome、Myasthenia gravis。
【获取与许可】
源站页面：https://zenodo.org/records/8371361
使用许可：cc-zero。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-09-23，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/records/8371361
（注册/登录后按页面指引下载）
数据说明
该数据集聚焦于重症肌无力（MG）的肠道微生物组研究，MG是一种神经肌肉接头疾病，其病理机制复杂且临床异质性高，目前缺乏明确的生物标志物。数据集包含从MG患者及非MG对照者粪便样本中提取的基因组DNA数据，通过构建扩增子序列变体（ASV）并完成代表性DNA序列的分类学注释，形成了基于ASV分类单元和完整ASV的微生物组成表格。研究采用四种机器学习方法（结合嵌套留一交叉验证）训练模型，识别出31个高重要性ASV（HIASV），其中毛螺菌科和瘤胃菌科细菌的丰度差异最为显著。这些HIASV可用于训练XGBoost算法以区分MG患者与非患者，模型展现出较高的诊断分类能力，并能准确预测MG患者。此外，毛螺菌科的丰度与肢体无力严重程度相关。该数据集主要应用于自身免疫性疾病微生物组标志物发现、机器学习辅助诊断及重症肌无力的病理机制探索。
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