UCSF-PDGM低级别胶质瘤

UCSF-PDGM 面向低级别胶质瘤及相关疾病研究,提供可公开访问的图像数据或临床/组学信息,适合用于分类、生物标志物探索、队列比较和算法验证等研究场景。

UCSFUCSF
TCIA
2024-01-01 更新
浏览 28
图像分类Diffuse Glioma
UCSF-PDGM

基本信息

模态
图像
数据量
501
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-01-01
版本
Complete

资源简介

UCSF-PDGM低级别胶质瘤

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开的影像数据集,收录 合计 142.00 GB、495 例受试者,主题涵盖 Diffuse Glioma,可用于医学图像分割、检测与分类模型的训练与评测,CC BY 4.0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《The University of California San Francisco Preoperative Diffuse Glioma MRI》。源站首次发布:2025/05/30。

【数据内容】

源站原始描述:Introduction MRI-based artificial intelligence (AI) research on patients with brain gliomas has been rapidly increasing in popularity in recent years in part due to a growing number of publicly available MRI datasets. Notable examples include The Cancer Genome Atlas Glioblastoma dataset (TCGA-GBM) consisting of 262 subjects and the International Brain Tumor Segmentation (BraTS) challenge dataset consisting of 542 subjects (including 243 preoperative cases from TCGA-GBM). The public availability…

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/tcia.bdgf-8v37。

【主题与分类】

源站学科分类:MR、Demographic、Molecular Test、Diagnosis、Other、Follow-Up。主题标签:Diffuse Glioma。

【适用方向】

影像类数据可用于医学图像分析模型(检测、分割、分类)的训练与评测,也可用于标注质量与成像参数相关性的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/ucsf-pdgm/

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Calabrese, E., Villanueva-Meyer, J., Rudie, J., Rauschecker, A., Baid, U., Bakas, S., Cha, S., Mongan, J., Hess, C. (2022). The University of California San Francisco Preoperative Diffuse Glioma MRI (UCSF-PDGM) (Version 5) [dataset]. The Cancer Imaging Archive

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使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据说明

UCSF-PDGM 是与低级别胶质瘤相关的公开数据集,涵盖图像数据,可用于分类、疾病表型分析或模型评估。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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