NCAR(对照)与R6/2小鼠表达mScarlet(对照)或Crym后的纹状体星形胶质细胞转录组

该数据集来自NCBI GEO,包含NCAR(对照)与R6/2小鼠在表达mScarlet(对照)或Crym后的纹状体星形胶质细胞转录组数据,采用高通量测序进行表达谱分析,共1个文件(GSE310059_series_matrix.txt.gz)

geo
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基因组分类GPL2110310090
GSE310059: Striatal astrocyte transcriptome in NCAR (Control) and R6/2 mice after expression of mScarlet (Control) or Crym

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-19

资源简介

NCAR(对照)与R6/2小鼠表达mScarlet(对照)或Crym后的纹状体星形胶质细胞转录组

Striatal astrocyte transcriptome in NCAR (Control) and R6/2 mice after expression of mScarlet (Control) or Crym

该数据集来自NCBI GEO,包含NCAR(对照)与R6/2小鼠在表达mScarlet(对照)或Crym后的纹状体星形胶质细胞转录组数据,采用高通量测序进行表达谱分析,共1个文件(GSE310059_series_matrix.txt.gz)。研究通过过表达Crym恢复其在NCAR和R6/2小鼠中的表达,并结合Rpl22-HA共表达评估R6/2小鼠的转录失调及Crym恢复后的转录挽救。数据可用于亨廷顿病背景下星形胶质细胞转录组变化及Crym功能研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Nov 17 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Crym已被证明主要在纹状体星形胶质细胞中表达,并参与持续性行为。然而,该基因在病理背景下的功能仍不清楚。在人类和小鼠模型的亨廷顿病中,Crym被发现下调。为了研究Crym在此背景下的作用,我们通过在NCAR和R6/2小鼠中过表达Crym来恢复其表达。与Rpl22-HA共表达使我们能够评估R6/2小鼠中的转录失调以及Crym恢复后的转录挽救。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL21103、10090。本站分类:神经系统疾病/亨廷顿病/舞蹈症。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE310059

【使用注意】

· 源站最后修改于 Sep 28 202,引用时请注意版本时效。

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Crym已被证明主要表达于纹状体星形胶质细胞,并参与持续性行为。然而,该基因在病理背景下的功能仍不清楚。在人类和小鼠模型的亨廷顿病中,发现Crym表达下调。为了研究Crym在此背景下的作用,我们通过在NCAR和R6/2小鼠中过表达Crym来恢复其表达。与Rpl22-HA的共表达使我们能够评估R6/2小鼠中的转录失调以及Crym恢复后的转录挽救。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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