GSE154141:细胞内在胶质病理在亨廷顿病人类与小鼠模型中保守

该数据集来自 NCBI GEO,标题为 GSE154141,聚焦亨廷顿病中细胞内在胶质病理在人类与小鼠模型间的保守性。数据属于神经系统疾病/亨廷顿病与舞蹈症分类,采用表达谱芯片技术,涉及平台 GPL1261 与物种编号 9606

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL12619606
GSE154141: Cell-intrinsic glial pathology is conserved across human and murine models of Huntington Disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-02

资源简介

GSE154141:细胞内在胶质病理在亨廷顿病人类与小鼠模型中保守

GSE154141 是一个来自 NCBI GEO 的基因表达数据集,标题为“Cell-intrinsic glial pathology is conserved across human and murine models of Huntington Disease”,即亨廷顿病中细胞内在的胶质病理在人类与小鼠模型之间具有保守性。该数据集归属于神经系统疾病下的亨廷顿病/舞蹈症分类,采用表达谱芯片技术,涉及平台 GPL1261 与物种编号 9606,作者为 John Mariani,发布时间为 Jul 09 202。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE154141_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集围绕亨廷顿病中胶质细胞病理的跨物种保守性这一主题组织表达谱数据,可供关注神经退行性疾病转录组特征的研究者参考使用。

【数据集背景】

亨廷顿病是一种神经系统疾病,在数据集的分类体系中与舞蹈症归入同一类别。该数据集的标题明确指出其研究关注点是“细胞内在的胶质病理”,并强调这一病理特征在人类与小鼠模型之间是保守的。这意味着数据集所承载的表达谱信息,定位于比较人类与小鼠标本中胶质细胞相关病理表现的研究框架之内。源站标题与数据集英文名一致,均为“Cell-intrinsic glial pathology is conserved across human and murine models of Huntington Disease”,说明该数据集是该研究工作的配套表达数据集合。源站描述仅说明这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成,未进一步展开各子系列的具体构成。

【数据内容】

数据集的文件数量为 1,文件样例为 GSE154141_series_matrix.txt.gz,属于系列矩阵文件形式。主题标签显示其数据类型为“Expression profiling by array”,即基于芯片的表达谱分析;涉及平台 GPL1261;物种编号为 9606。数据集分类为神经系统疾病 / 亨廷顿病/舞蹈症。除上述信息外,源站未提供关于样本数量、分组设计、检测基因数量、具体表达矩阵维度等更细的内容。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI GEO,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。作者为 John Mariani,发布时间为 Jul 09 202。源站描述说明该 SuperSeries 由下方列出的 SubSeries 组成,但未提供各 SubSeries 的名称与内容。关于样本采集的具体组织来源、供体信息、实验处理与芯片杂交流程等,源站未提供。

【适用场景】

基于其分类与技术标签,该数据集适用于神经系统疾病尤其是亨廷顿病/舞蹈症相关的表达谱研究场景,例如围绕胶质细胞病理的转录组特征分析、人类与小鼠模型之间表达模式的比较性探索,以及以芯片表达数据为基础的方法学验证。由于数据集标题强调跨物种保守性,它也可能用于支持跨物种表达数据整合与对照分析的场景。需要说明的是,以上适用方向依据数据集的分类、标题与技术标签组织,源站未提供针对具体分析任务的说明。

【使用方法】

使用时可下载数据文件 GSE154141_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式,需按对应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。由于数据集仅包含 1 个文件,使用时应以该系列矩阵文件为主要数据入口。关于芯片平台注释文件的获取与探针到基因的映射细节,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,源站描述较为简略,仅说明其为由 SubSeries 组成的 SuperSeries,未提供样本量、重复设置、质控指标等信息,因此无法依据现有信息评估其数据质量水平。数据集发布时间标注为 Jul 09 202,年份信息不完整。使用者在开展比较分析前,应自行核对文件字段与编码,并注意该数据集在物种与平台方面的限定:物种编号为 9606,平台为 GPL1261。关于数据的具体限制与偏差,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的作者为 John Mariani,来源站为 NCBI GEO。关于引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE154141

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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