前驱期亨廷顿病患者脑脊液miRNA表达数据集

该数据集来自NCBI,包含前驱期亨廷顿病患者脑脊液(CSF)中microRNA(miRNA)的表达谱数据,采用高通量测序技术进行非编码RNA分析

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基因组分类GPL185739606
GSE150174: miRNA Expression from Cerebrospinal Fluid (CSF) from Prodromal Huntington Disease Patients

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

前驱期亨廷顿病患者脑脊液miRNA表达数据集

GSE150174 数据集来源于 NCBI,主题为前驱期亨廷顿病患者脑脊液(CSF)中 microRNA(miRNA)的表达分析。该数据集采用高通量测序技术开展非编码 RNA 表达谱研究,属于神经系统疾病领域中亨廷顿病/舞蹈症相关数据资源。数据集由 Richard H. Myers 提交,发布时间为 2024 年 5 月 9 日,共包含 1 个数据文件,样例文件为 GSE150174_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集面向亨廷顿病前驱期的分子层面研究,提供脑脊液 miRNA 表达信息,可供关注神经退行性疾病生物标志物与转录后调控机制的研究者参考使用。

【数据集背景】

亨廷顿病是一种神经系统疾病,前驱期指疾病典型症状尚未完全显现的阶段。该数据集聚焦于前驱期亨廷顿病患者脑脊液中的 miRNA 表达情况,试图从非编码 RNA 层面刻画这一阶段的分子特征。源站描述指出,该数据集用于分析前驱期亨廷顿病患者脑脊液中的 microRNA(miRNA)表达。数据集在分类上归入神经系统疾病 / 亨廷顿病/舞蹈症,主题标签涉及非编码 RNA 高通量测序表达谱分析,物种标签为 9606(即人类),平台编号为 GPL18573。

【数据内容】

数据集包含 1 个文件,样例文件名为 GSE150174_series_matrix.txt.gz,格式为 GZIP 压缩包。该文件为系列矩阵文件,通常用于汇总样本层面的表达谱信息。数据集主题标签表明其属于“Non-coding RNA profiling by high throughput sequencing”,即基于高通量测序的非编码 RNA 表达谱分析。数据内容围绕脑脊液样本中的 miRNA 表达展开,具体样本数量、分组信息、检测到的 miRNA 数目以及表达量数值等细节,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为“miRNA Expression from Cerebrospinal Fluid (CSF) from Prodromal Huntington Disease Patients”。数据集作者为 Richard H. Myers,发布时间为 2024 年 5 月 9 日。生物样本类型为前驱期亨廷顿病患者的脑脊液(CSF)。测序平台编号为 GPL18573,物种为人类(9606)。关于样本采集地点、采集流程、伦理审批信息及测序具体参数等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于非编码 RNA 表达谱相关研究,尤其是针对前驱期亨廷顿病患者脑脊液 miRNA 的表达分析。潜在应用方向包括:比较前驱期患者与对照或其他阶段样本的 miRNA 表达差异,探索脑脊液 miRNA 作为神经退行性疾病分子标志物的可能性,以及结合高通量测序数据开展非编码 RNA 调控网络分析。由于数据集归类于亨廷顿病/舞蹈症,也可用于神经系统疾病领域的生物信息学方法验证与数据整合研究。具体研究结论需以数据实际内容为准,源站未提供相关分析结果。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE150174_series_matrix.txt.gz。该文件为 GZIP 压缩包,需按对应格式解压后读取。建议先在小样本上核对字段名称、数据编码与样本标识,确认无误后再批量接入分析流程。由于数据集仅包含 1 个系列矩阵文件,使用时应结合平台编号 GPL18573 了解对应的检测平台信息。关于文件内部字段的具体含义与注释信息,源站未提供,需在使用时自行核对。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1,内容以系列矩阵形式汇总,未提供原始测序读段文件或其他辅助文件。样本量、分组设计、数据完整性及质控指标等信息源站未提供,因此难以在数据层面直接评估其统计效力与质量水平。此外,数据集仅覆盖前驱期亨廷顿病患者脑脊液样本,是否包含对照样本及其他疾病阶段样本,源站未提供。使用者在开展比较分析前应自行核查数据结构与样本构成。

【引用与许可】

数据集作者为 Richard H. Myers,来源站为 NCBI。使用该数据集时,建议引用其源站标题与访问编号 GSE150174。关于数据许可条款、使用限制及具体引用格式,源站未提供,使用者应参照 NCBI 相关数据使用政策执行。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE150174

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Analysis of microRNA (miRNA) expression in CSF from prodromal Huntington disease patients.

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