冷冻电镜揭示ATTR淀粉样变性中淀粉样原纤维的结构多态性

该数据集来自omicsdi.org,主题标签为Proteomics,归类于神经系统疾病与遗传性周围神经病。数据涉及ATTRv-I84S突变样本与野生型对照样本中胰蛋白酶与非胰蛋白酶片段的鉴定,包含野生型样本ID 1120233,以及I84S患者样本ID 1123799、1123800、1123801

omicsdi
浏览 14
蛋白质分类Proteomics
Structural polymorphism of amyloid fibrils in ATTR amyloidosis revealed by cryo-electron microscopy

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

冷冻电镜揭示ATTR淀粉样变性中淀粉样原纤维的结构多态性

该数据集围绕转甲状腺素蛋白淀粉样变性(ATTR amyloidosis)相关的结构多态性研究展开,英文名称为“Structural polymorphism of amyloid fibrils in ATTR amyloidosis revealed by cryo-electron microscopy”,在来源站omicsdi.org上归类于神经系统疾病与遗传性周围神经病方向,主题标签为Proteomics。数据集的核心内容涉及对ATTRv-I84S突变样本与野生型对照样本中胰蛋白酶与非胰蛋白酶片段的鉴定,涵盖一个野生型样本和三个来自不同患者的I84S突变样本。整体而言,该数据集为研究ATTR淀粉样变性中淀粉样纤维的结构多态性提供了蛋白质组学层面的片段鉴定信息,并关联了特定突变型与野生型之间的对照数据。

【数据集背景】

ATTR淀粉样变性是一类由转甲状腺素蛋白(transthyretin)异常沉积引起的疾病,可累及神经系统,属于遗传性周围神经病的重要类型。该数据集所对应的研究主题聚焦于利用冷冻电镜技术揭示ATTR淀粉样变性中淀粉样纤维的结构多态性。在蛋白质组学层面,研究者关注的是样本中胰蛋白酶与非胰蛋白酶片段的鉴定情况,以此作为理解淀粉样纤维组成与结构差异的基础。数据集在来源站被归入神经系统疾病与遗传性周围神经病分类,主题标签为Proteomics,说明其定位介于神经疾病研究与蛋白质组学分析之间。

【数据内容】

数据集包含对ATTRv-I84S突变样本以及野生型对照样本中胰蛋白酶和非胰蛋白酶片段的鉴定结果。具体样本包括:野生型样本,样本ID为1120233;I84S突变样本共三个,分别对应不同患者,样本ID为1123799(Patient 2)、1123800(Patient 3)和1123801(Patient 1)。这些样本的片段鉴定信息在源站描述中被标注为补充表2的内容。数据内容的核心在于区分胰蛋白酶与非胰蛋白酶片段,从而为比较突变型与野生型样本的蛋白质组学特征提供依据。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。源站描述中提及了样本ID与患者编号的对应关系,但未提供具体的采集方法、实验条件、仪器平台或样本处理流程等细节。关于数据采集的时间、地点、伦理审批信息以及原始数据的具体存储位置,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与ATTR淀粉样变性相关的蛋白质组学研究,尤其是涉及ATTRv-I84S突变与野生型对照比较的分析场景。由于主题标签为Proteomics,其潜在用途包括鉴定样本中的胰蛋白酶与非胰蛋白酶片段、支持淀粉样纤维结构多态性的辅助分析,以及为遗传性周围神经病相关研究提供片段层面的参考信息。此外,该数据集也可用于方法学比较或作为突变型与野生型样本对照的示例数据。

【使用方法】

源站未提供具体的使用方法说明。关于如何下载、解析或重新分析该数据集中的片段鉴定结果,以及是否需要特定软件或流程,源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、覆盖度、重复性、置信度或技术限制的说明。样本数量方面,数据集包含一个野生型样本和三个I84S突变样本,但源站未说明这些样本是否具有统计学代表性或是否存在其他未列出的样本。此外,源站未提供数据缺失情况、潜在偏差或验证信息。

【引用与许可】

源站未提供引用格式、许可协议或使用条款信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000093062

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Identification of tryptic and non tryptic fragments in ATTRv-I84S and wild type control sample (Supplementary table 2). Sample ID 1120233: wild type Sample ID 1123799: I84S, Patient 2 Sample ID 1123800: I84S, Patient 3 Sample ID1123801: I84S, Patient 1

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