弓形虫基因组数据库
Toxoplasma gondii ToxoDB 面向CNS机会性感染及相关疾病研究，提供公开可访问的表格数据或临床标注信息，适合用于分类、疾病表型分层、风险预测、机制探索和算法基准测试等研究场景。
基本信息
资源简介
弓形虫基因组数据库
【一句话概览】
ToxoDB 现已推出 Release 71 beta 版，这是一次重大更新，包含基础设施变更，可提升性能、可持续性与成本效率（详见发布说明）。官方表示，如遇难以查找或运行异常的情况，请联系他们。上一版本仍可在旧版站点上使用。该资源涉及基因组学、表型数据、以群体为中心的数据、基因组浏览器、转录组学、蛋白质组学、代谢通路、遗传变异及单细胞 RNA 测序等内容（来源 toxodb.org）。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《ToxoDB》。
【数据内容】
源站原始描述：ToxoDB is now on Release 71 beta, a major update with infrastructure changes that improve performance, sustainability, and cost-efficiency (see release notes). Please contact us if anything is hard to find or is not working as expected. The previous release remains available on a legacy site
中文译文（机器翻译，仅供快速理解，请以原文为准）：ToxoDB现已发布Release 71 beta版，这是一次重大更新，涉及基础设施的改动，旨在提升性能、可持续性和成本效益（详见发布说明）。如遇查找困难或功能异常，请与我们联系。上一版本仍可在旧版网站上获取。
【主题与分类】
主题标签：ToxoDB、VEuPathDB、genomics、phenotypic data、population-centric data、genome browser、transcriptomics、proteomics、metabolic pathways、genetic variation。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://toxodb.org/toxo/app
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://toxodb.org/toxo/app
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Toxoplasma gondii ToxoDB 是与CNS机会性感染相关的公开数据集，包含表格数据，可用于分类、表型识别、疾病机制分析或模型评估。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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