烟雾病脑脊液miRNA表达数据集

数据基于GPL25134平台,物种为人类(9606),属于非编码RNA表达谱分析。可用于研究烟雾病脑脊液中miRNA的表达特征,探索其作为生物标志物的潜力,并为神经系统疾病相关的非编码RNA机制研究提供数据支持(来源 NCBI)

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基因组分类Non-coding RNA profiling by arrayGPL251349606
GSE129792: miRNA expression in cerebrospinal fluid with moyamoya disease

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-25

资源简介

烟雾病脑脊液miRNA表达数据集

GSE129792 是一个聚焦于烟雾病(moyamoya disease)脑脊液 miRNA 表达特征的非编码 RNA 表达谱数据集,由 Wang Gang 提交,发布于 NCBI 站点,发布时间为 2019 年 4 月 15 日。该数据集通过芯片分析技术检测烟雾病患者脑脊液中 miRNA 的表达谱,物种为人类(9606),所用平台为 GPL25134,属于非编码 RNA 表达谱分析范畴。数据集共包含 1 个文件,样例文件为 GSE129792_series_matrix.txt.gz。在分类上,它被归入神经系统疾病以及颈动脉/椎动脉狭窄及夹层方向,可用于研究烟雾病脑脊液中 miRNA 的表达特征,探索其作为生物标志物的潜力,并为神经系统疾病相关的非编码 RNA 机制研究提供数据支持。

【数据集背景】

烟雾病是一种以颈内动脉末端及大脑前、中动脉起始部进行性狭窄或闭塞为特征的脑血管疾病,其发病机制复杂,涉及血管新生、炎症反应等多个层面。脑脊液与中枢神经系统直接接触,其中的非编码 RNA 分子可能反映中枢神经系统的病理生理状态。该数据集正是基于这一背景,采用芯片分析手段,测定烟雾病患者脑脊液中 miRNA 的表达谱,为理解该疾病在非编码 RNA 层面的分子特征提供数据基础。源站描述明确指出,研究目的是通过芯片分析确定烟雾病脑脊液中 miRNA 的表达谱。

【数据内容】

该数据集属于非编码 RNA 表达谱分析类型,主题标签包括 Non-coding RNA profiling by array、GPL25134 以及 9606。数据以芯片表达谱矩阵的形式组织,文件数量为 1 个,样例文件名为 GSE129792_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。矩阵文件中通常包含样本信息与各 miRNA 探针的表达数值,可用于比较不同样本间 miRNA 表达水平的差异。数据集所覆盖的样本数量、具体 miRNA 数目以及分组设计等信息,源站未提供。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),由 Wang Gang 提交,发布时间为 2019 年 4 月 15 日。检测对象为人类脑脊液样本中的 miRNA,检测平台为 GPL25134,分析方法为芯片(microarray)表达谱分析。样本采集的具体流程、纳入排除标准、脑脊液处理与 RNA 提取方法等实验细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究烟雾病脑脊液中 miRNA 的表达特征,探索 miRNA 作为该疾病生物标志物的潜力;也可作为神经系统疾病相关非编码 RNA 机制研究的参考数据,用于与其他脑血管疾病或神经系统疾病的表达谱进行比较分析。此外,基于芯片平台的非编码 RNA 表达谱数据也适合用于候选 miRNA 的筛选与验证研究。具体可支持的统计分析与验证方向,需结合数据实际内容确定,源站未提供更多说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE129792_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包,需按对应格式解压读取。建议先在小样本上核对字段结构与编码方式,确认样本标识、探针标识与表达数值的对应关系无误后,再进行批量接入与后续分析。分析时可结合平台注释信息将探针映射至相应 miRNA,并根据研究设计进行分组比较。具体的分析流程与参数设置,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集文件数量为 1 个,以矩阵形式提供表达谱信息,未提供原始芯片图像文件或其他中间数据。样本量、重复设计、数据归一化方法以及质控指标等信息,源站未提供。由于仅涉及烟雾病脑脊液样本的 miRNA 表达谱,结果的推广需谨慎,是否适用于其他人群或其他神经系统疾病,需结合独立数据验证。使用前应自行评估数据质量与适用性。

【引用与许可】

该数据集由 Wang Gang 提交至 NCBI,引用时应注明数据集编号 GSE129792 及来源站点 ncbi.nlm.nih.gov。具体的许可条款与使用限制,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE129792

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们进行了微阵列分析,以确定烟雾病脑脊液中miRNA的表达谱。

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