复合杂合FRDA患者FXN 165+5G>C点突变剪接缺陷的矫正
该数据集来自NCBI GEO,聚焦携带FXN 165+5G>C点突变的复合杂合Friedreich共济失调患者,包含1个高通量表达谱文件

基本信息
资源简介
复合杂合FRDA患者FXN 165+5G>C点突变剪接缺陷的矫正
Correction of splicing defect in compound heterozygous FRDA patient carrying FXN 165+5G>C point mutation.
该数据集来自NCBI GEO,聚焦携带FXN 165+5G>C点突变的复合杂合Friedreich共济失调患者,包含1个高通量表达谱文件。源站描述显示,该突变导致FXN mRNA和蛋白水平显著下调,转录组与RT-PCR分析揭示异常剪接,并可被靶向内含子1的反义寡核苷酸部分矫正。数据可用于研究FXN剪接调控机制及评估ASO矫正效果(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Mar 28 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):Friedreich共济失调是一种由FXN基因突变引起的常染色体隐性遗传病。约95%的患者在FXN内含子1中携带纯合GAA重复扩增,其余5%为复合杂合子,一个等位基因携带GA扩增,另一个等位基因携带点突变。在此,我们表征了FXN内含子1第5位的一个G到C颠换。该突变导致FXN mRNA和蛋白水平显著下调。转录组和RT-PCR分析表明,该突变引起FXN基因的异常剪接,而靶向内含子1的反义寡核苷酸(ASOs)至少可以部分矫正这种异常剪接。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24676、9606。本站分类:神经系统疾病/共济失调。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE262763
【使用注意】
· 源站最后修改于 Jul 31 202,引用时请注意版本时效。
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- OpenDataLab:
数据说明
Friedreich共济失调是一种由FXN基因突变引起的常染色体隐性遗传病。约95%的患者携带FXN基因内含子1的纯合GAA重复扩增,其余5%为复合杂合子,一条等位基因携带GA扩增,另一条等位基因携带点突变。在此,我们对FXN基因内含子1第5位的一个G到C的颠换进行了特征分析。该突变导致FXN mRNA和蛋白水平显著下调。转录组和RT-PCR分析表明,该突变引起FXN基因异常剪接,而靶向内含子1的反义寡核苷酸(ASOs)至少可部分纠正这一异常剪接。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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