K562细胞中FXN遗传相互作用筛选数据集
该数据集来自NCBI GEO，标题为GSE242192，是在K562细胞中针对FXN基因进行的遗传相互作用筛选，旨在鉴定在Fe-S簇合成不足时表现为合成致病或缓冲的基因
基本信息
资源简介
K562细胞中FXN遗传相互作用筛选数据集
Genetic interaction screen for FXN in K562 cells, to identify genes that are synthetic sick/buffering in the absence of robust Fe-S cluster synthesis
该数据集来自NCBI GEO，标题为GSE242192，是在K562细胞中针对FXN基因进行的遗传相互作用筛选，旨在鉴定在Fe-S簇合成不足时表现为合成致病或缓冲的基因。源站描述指出Friedreich共济失调由线粒体蛋白frataxin（FXN）缺失引起，通过遗传相互作用图谱发现FXN缺失下游线粒体翻译受损，并提示METTL17为候选效应因子。数据集包含1个文件，可用于研究FXN缺失的细胞后果及相关基因功能（来源 NCBI）。
【数据集背景】
源站首次发布：Sep 01 202。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：Friedreich共济失调（FA）是最常见的单基因线粒体疾病。FA由线粒体蛋白frataxin（FXN）的耗竭引起，FXN是一种铁硫（Fe-S）簇生物发生因子。为了更好地理解FA的细胞后果，我们在对照或FXN编辑细胞中进行了遗传相互作用图谱分析。该筛选鉴定了FXN缺失下游的线粒体翻译受损，并特别突出甲基转移酶样蛋白METTL17作为候选效应因子。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签：Other、GPL15520、9606。本站分类：神经系统疾病/共济失调。
【获取与许可】
源站页面：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242192
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 17 202，引用时请注意版本时效。
下载信息
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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE242192
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
弗里德赖希共济失调（FA）是最常见的单基因线粒体疾病。FA由线粒体蛋白frataxin（FXN）的耗竭引起，FXN是一种铁硫（Fe-S）簇生物合成因子。为更好地理解FA的细胞学后果，我们在对照细胞或FXN编辑细胞中进行了遗传相互作用图谱分析。该筛选鉴定出FXN缺失下游的线粒体翻译受损，并特别突显了甲基转移酶样蛋白METTL17作为候选效应因子。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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