20-22月龄NonTg、PS2APP和TauPS2APP小鼠海马单细胞RNA测序

研究通过无偏单细胞RNA测序分析携带淀粉样病理(PS2APP)或淀粉样与tau联合病理(TauPS2APP)的AD小鼠模型海马细胞变化,鉴定出16种细胞类型,并刻画小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对单一淀粉样病理及淀粉样联合tau病理的响应

omicsdi
浏览 15
基因组分类Transcriptomics
Single-cell RNA-Seq of NonTg, PS2APP and TauPS2APP mouse hippocampi, 20-22 months old

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

20-22月龄NonTg、PS2APP和TauPS2APP小鼠海马单细胞RNA测序

该数据集来自omicsdi.org,包含20-22月龄NonTg、PS2APP和TauPS2APP小鼠海马的单细胞RNA测序数据。研究通过无偏单细胞RNA测序分析携带淀粉样病理(PS2APP)或淀粉样与tau联合病理(TauPS2APP)的AD小鼠模型海马细胞变化,鉴定出16种细胞类型,并刻画小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对单一淀粉样病理及淀粉样联合tau病理的响应。数据可用于研究AD病理下的转录组响应及疾病发生发展分子机制(来源 omicsdi.org)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):在此,我们通过无偏单细胞RNA测序研究了携带淀粉样病理(PS2APP)或淀粉样与tau联合病理(TauPS2APP)的AD小鼠模型海马细胞的细胞水平变化。我们鉴定出16种不同的细胞类型,并进一步刻画了小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对仅淀粉样变以及淀粉样加tau联合病理的响应。两种小鼠模型均表现出强烈的小胶质细胞响应。我们还发现少突胶质细胞对不同AD病理的响应存在差异。我们观察到两种小鼠模型中T细胞数量均增加。当前数据集呈现了对AD病理的多样化转录组响应,并为研究疾病发生和进展的分子机制提供了资源。

【主题与分类】

主题标签:Transcriptomics。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE181786

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/geo/GSE181786

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究通过无偏倚的单细胞RNA测序,在携带淀粉样蛋白病理的AD小鼠模型(PS2APP)或同时具有淀粉样蛋白和tau蛋白联合病理的模型(TauPS2APP)中,探究了海马细胞的细胞水平变化。我们鉴定出16种不同的细胞类型,并进一步描述了小胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对仅有淀粉样变性以及淀粉样蛋白加tau蛋白联合病理的反应特征。两种小鼠模型均表现出强烈的小胶质细胞反应。我们还发现少突胶质细胞对不同AD病理具有不同的反应。我们观察到两种小鼠模型中T细胞数量均增加。当前数据集呈现了对AD病理的多样化转录组反应,并为研究疾病发生和进展的分子机制提供了资源。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案