SEA-AD：西雅图阿尔茨海默病脑细胞图谱
本站分类：神经系统疾病/阿尔茨海默病。本数据集为神经系统疾病领域公开数据集，主题涵盖dementia。本数据集为神经系统疾病领域的基因组公开数据集，来源：cellxgene，主题涵盖dementia。
基本信息
资源简介
SEA-AD：西雅图阿尔茨海默病脑细胞图谱
SEA-AD（Seattle Alzheimer’s Disease Brain Cell Atlas，西雅图阿尔茨海默病脑细胞图谱）是一个面向阿尔茨海默病及神经系统疾病研究的公开数据集，收录于 cellxgene.cziscience.com 平台，本站将其归类于神经系统疾病／阿尔茨海默病方向。该数据集围绕痴呆（dementia）与正常（normal）两类主题标签组织，旨在为研究阿尔茨海默病相关脑组织中的细胞特征提供数据基础。作为一项由多机构联合推进的联盟成果，SEA-AD 汇集了来自脑库的死后脑组织研究数据，并依托公开数据平台向研究社区开放，供神经科学、神经病理学及计算生物学等领域的研究者探索使用。
【数据集背景】
SEA-AD 全称为 Seattle Alzheimer’s Disease Brain Cell Atlas，即西雅图阿尔茨海默病脑细胞图谱。该联盟由 Allen Institute for Brain Science、华盛顿大学（University of Washington）以及 Kaiser Permanente Washington Research Institute 共同组成。项目获得美国国家老龄化研究所（National Institutes on Aging，NIA）资助，资助编号为 U19AG060909。数据集聚焦于阿尔茨海默病这一神经系统疾病，主题标签涵盖痴呆与正常状态，属于脑细胞图谱类研究资源。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 dementia 与 normal，本站分类为神经系统疾病／阿尔茨海默病。源站描述指出，数据集页面上的“Download”按钮所指向的版本，其元数据被大幅削减，基因数量也有所减少。造成这一情况的原因是 10x Genomics 官方人类参考基因组注释与 CELLxGENE 所使用的基因组注释之间存在不一致。因此，源站明确建议，若出于下载目的，应强烈推荐使用完整、官方的数据集版本，即通过页面右侧的“DOWNLOAD OFFICIAL DATASET”链接前往其 AWS Open Data Registry 获取。除上述内容外，关于数据集的具体样本数量、细胞数目、基因规模、受试者信息等细节，源站未提供。
【采集与来源】
研究数据生成自死后脑组织，这些组织来源于华盛顿大学 BioRepository and Integrated Neuropathology（BRaIN）实验室以及 Precisi——源站描述在此处中断，未提供该机构或项目的完整名称与后续说明。数据集由 SEA-AD 联盟发布，来源站为 cellxgene.cziscience.com。关于供体数量、取材脑区、伦理审批与知情同意等具体采集信息，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与分类，该数据集适用于阿尔茨海默病及痴呆相关的神经系统疾病研究，可用于探索脑组织细胞层面的特征。由于数据集同时包含痴呆与正常两类主题标签，理论上可用于对比研究。但源站未提供关于具体分析用途、推荐分析流程或已验证应用场景的说明，相关适用场景需使用者结合自身研究目的判断。
【使用方法】
源站提示，数据集页面上的“Download”按钮所获取的版本存在元数据大幅减少与基因数量减少的问题，原因是基因组注释不一致。因此，源站强烈建议通过页面右侧的“DOWNLOAD OFFICIAL DATASET”链接，前往 AWS Open Data Registry 下载完整、官方的数据集版本。关于数据格式、文件结构、加载方式与配套工具等具体使用细节，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主要限制已在源站描述中明确：通过页面“Download”按钮获得的版本元数据大幅减少、基因数量减少，其成因是 10x Genomics 官方人类参考基因组注释与 CELLxGENE 所用注释之间的不一致。因此源站建议使用官方完整版本。除此之外，关于数据质量评估、批次效应、覆盖度、偏差等其它质量维度，源站未提供。
【引用与许可】
SEA-AD 联盟由 Allen Institute for Brain Science、华盛顿大学与 Kaiser Permanente Washington Research Institute 组成，项目受美国国家老龄化研究所（NIA）资助，资助编号 U19AG060909。关于数据的具体引用格式、许可条款与使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://cellxgene.cziscience.com/collections/1ca90a2d-2943-483d-b678-b809bf464c30
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
西雅图阿尔茨海默病脑细胞图谱（SEA-AD）联盟包括艾伦脑科学研究所、华盛顿大学和凯撒永久华盛顿研究所。SEA-AD由国家老龄化研究所（NIA）资助，资助编号为U19AG060909。重要提示：下方的“下载”按钮所指向的数据集版本，由于10x Genomics官方人类参考基因组注释与CELLxGENE所使用的注释之间存在不一致，其元数据大幅减少，基因数量也有所缩减。如需下载，我们强烈建议使用右侧的“下载官方数据集”链接，以获取完整、官方的数据集，该链接将引导您前往我们的AWS开放数据注册中心。研究数据来源于华盛顿大学生物样本库与综合神经病理学（BRaIN）实验室及精准神经病理学核心所获取的死后脑组织，该实验室和核心得到华盛顿大学阿尔茨海默病研究中心（P50AG005136和P30AG066509）以及成人思维变化研究（U01AG006781和U19AG066567）的NIH资助。
ACT研究是一项基于人群的纵向前瞻性队列研究，针对西雅图大都会地区的脑老化及新发痴呆。ACT是Kaiser Permanente华盛顿健康研究所的一个数据存储库，该研究所已制定与外部研究者共享数据的政策和程序。从本研究网站获取的数据无需额外的机构审查委员会（IRB）批准或授权。疾病：痴呆，正常。组织：背外侧前额叶皮层，中颞回。检测方法：10x 3’ v3，10x multiome。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
