遗传性额颞叶痴呆GENFI研究原始蛋白质组学数据

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3Ac53f82f48a47d0156300e5abe6d01e98287af4195d648e88bfce8d4d77d67dc0

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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数据说明

我们采用非靶向质谱方法，即串联质谱标签（TMT）蛋白质组学，来识别遗传性额颞叶痴呆（FTD）中的生物标志物特征。共分析了来自遗传性FTD倡议（GENFI）的238份脑脊液（CSF）样本，其中包括107名症状前突变携带者（44名C9orf72，38名GRN，25名MAPT）和55名有症状突变携带者（27名C9orf72，17名GRN，11名MAPT），以及76名突变阴性对照（“非携带者”）。我们发现每种遗传型FTD中均存在共有和特异性的蛋白质组改变。在有症状突变携带者与非携带者相比显著改变的蛋白质中，我们发现YWHAZ、YWHAG、UCHL1、NPTXR、NPTX2和FABP3在所有三种遗传型中均发生变化，并且在先前发表的数据集中的阿尔茨海默病患者中也是如此。我们观察到有症状突变携带者中溶酶体蛋白的差异性变化，其中MAPT携带者的丰度显著降低。

此外，我们鉴定出mu…，参与者与样本采集 参与者从GENFI研究中招募，该研究包括因MAPT、GRN或C9orf72致病性突变而被诊断为FTD的个体（症状性突变携带者）、有风险的一级亲属（症状前突变携带者）以及非携带者（来自同一家族的突变阴性一级亲属）。队列的人口统计学特征见表1。参与者通过标准化病史采集和检查进行评估，若符合共识诊断标准则被归类为症状性（51, 52）。采用国家阿尔茨海默病协调中心额颞叶变性部分的CDR痴呆分期工具（CDR® plus NACC FTLD）评估疾病严重程度，本文定量分析使用CDR® plus NACC FTLD盒子总和（SOB）。参与者接受了容积T1加权MRI扫描。有关临床评估和影像学的更多详细信息可见于

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。