基于plexDIA质谱的阿尔茨海默病人前额叶皮层单细胞蛋白质组图谱

该数据集来自omicsdi.org,提供超过2000个分离自人前额叶皮层(Brodmann 9区)的单细胞蛋白质组数据,样本来自八位女性个体,包括六位处于不同疾病进展阶段的阿尔茨海默病患者(Braak II、V、VI期)和两位非AD对照受试者(Braak 0期)

omicsdi
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蛋白质分类Proteomics
Proteomic profiling of single cells from human prefrontal cortex in Alzheimer's Disease using multiplexed data independent acquisition (plexDIA) mass spectrometry

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

基于plexDIA质谱的阿尔茨海默病人前额叶皮层单细胞蛋白质组图谱

该数据集名为“Proteomic profiling of single cells from human prefrontal cortex in Alzheimer's Disease using multiplexed data independent acquisition (plexDIA) mass spectrometry”,来源于omicsdi.org,归类于神经系统疾病中的阿尔茨海默病方向。数据集提供了超过2000个分离自人前额叶皮层(Brodmann 9区)的单细胞蛋白质组数据,样本来自八位女性个体,其中包括六位处于不同疾病进展阶段的阿尔茨海默病患者(Braak II、V、VI期)和两位非AD对照受试者(Braak 0期)。该数据集以Proteomics为主题标签,采用多重数据非依赖采集(plexDIA)质谱技术进行蛋白质组分析,旨在为阿尔茨海默病前额叶皮层单细胞水平的蛋白质组研究提供数据资源。

【数据集背景】

阿尔茨海默病是一种常见的神经系统退行性疾病,其病理进展通常与Braak分期相关。前额叶皮层作为高级认知功能的重要脑区,在阿尔茨海默病中可能发生显著的分子改变。然而,传统批量组织蛋白质组分析难以揭示细胞间的异质性。该数据集聚焦于人前额叶皮层(Brodmann 9区)的单细胞蛋白质组,通过纳入不同Braak分期的阿尔茨海默病患者与非AD对照,为研究疾病进展过程中细胞水平的蛋白质变化提供了基础数据。

【数据内容】

该数据集包含超过2000个分离自人前额叶皮层的单细胞蛋白质组数据。样本来源为八位女性个体,其中六位为阿尔茨海默病患者,分别处于Braak II、V、VI期,代表不同的疾病进展阶段;另外两位为非AD对照受试者,Braak 0期。数据集的主题标签为Proteomics,表明其核心内容为蛋白质组学数据。所有数据均基于单细胞分离和plexDIA质谱技术获取,具体蛋白质种类、定量数值及细胞类型注释等信息源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于omicsdi.org。样本采集自人前额叶皮层(Brodmann 9区),共涉及八位女性个体。其中六位阿尔茨海默病患者的Braak分期分别为II、V、VI期,两位对照受试者为Braak 0期。数据采集采用多重数据非依赖采集(plexDIA)质谱技术,该技术用于单细胞蛋白质组分析。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及质谱仪器型号、色谱条件等细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于阿尔茨海默病前额叶皮层单细胞蛋白质组的相关研究。具体而言,可用于探索不同Braak分期下前额叶皮层单细胞蛋白质表达的变化,分析阿尔茨海默病患者与非AD对照之间的蛋白质组差异,以及研究细胞水平的异质性。此外,该数据集也可作为方法学参考,用于plexDIA质谱技术在单细胞蛋白质组学中的应用评估。由于数据集仅包含女性个体,其适用场景可能限于女性样本相关的研究。其他潜在应用场景源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过omicsdi.org获取。关于数据的具体使用方式,如文件格式、数据下载链接、预处理步骤、分析工具推荐等,源站未提供。用户需参考源站提供的原始描述或相关数据说明进行操作。由于源站未提供详细的使用指南,建议用户直接访问omicsdi.org查询该数据集的进一步信息。

【质量与限制】

该数据集提供了超过2000个单细胞蛋白质组数据,样本来自八位女性个体,涵盖阿尔茨海默病不同Braak分期及非AD对照。然而,数据集仅包含女性个体,可能限制其在性别差异研究中的适用性。此外,样本量较小(八位个体),且Braak分期分布不均(II、V、VI期及0期),可能影响统计效力。关于数据质量的具体指标,如蛋白质检出数、定量准确性、批次效应等,源站未提供。其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的引用方式及许可信息源站未提供。用户在使用时应遵循omicsdi.org的相关规定,并参考源站可能提供的引用要求。由于源站未提供具体的引用格式或许可条款,建议用户直接访问omicsdi.org获取最新信息。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/massive/MSV000098015

标准获取流程:

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们在此提供了一个数据集,包含来自八位女性个体的人类前额叶皮层(布罗德曼9区)的2000多个分离单细胞——其中六位是处于不同疾病进展阶段的阿尔茨海默病患者(Braak II、V、VI期),以及两位非AD对照受试者(Braak 0期)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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