hiPSC来源星形胶质细胞的CROP-seq（scRNA-Seq）
该数据集为 BioProject 收录的 CROP-seq 单细胞 RNA 测序数据，研究对象为 hiPSC 来源的星形胶质细胞，属于神经系统疾病与阿尔茨海默病相关方向
基本信息
资源简介
hiPSC来源星形胶质细胞的CROP-seq（scRNA-Seq）
该数据集为 BioProject 收录的 CROP-seq 单细胞 RNA 测序数据，研究对象为 hiPSC 来源的星形胶质细胞，属于神经系统疾病与阿尔茨海默病相关方向。BioProject 是围绕单一研究计划汇集生物数据的资源集合，这些数据来自单一机构或联合体，记录为用户提供统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集英文名称为 PRJNA755725: CROP-seq of hiPSC-derived astrocytes (scRNA-Seq)，源站标题为“CROP-seq of hiPSC-derived astrocytes (scRNA-Seq) (ID 755725) - BioProject - NCBI”，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，本站分类归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病，主题标签为 Other。整体而言，该数据集面向以人诱导多能干细胞来源星形胶质细胞为对象的 CROP-seq 单细胞转录组研究，可用于神经系统疾病尤其是阿尔茨海默病相关方向的数据检索与再利用。
【数据集背景】
该数据集属于 BioProject 体系下的项目记录。BioProject 的定位是汇集与单一研究计划相关的生物数据，这些计划可来自单一机构或联合体，记录本身提供统一入口，帮助用户定位该项目生成的不同数据类型。该数据集聚焦于 hiPSC 来源的星形胶质细胞，采用 CROP-seq 结合单细胞 RNA 测序的技术路线。星形胶质细胞是中枢神经系统中的重要细胞类型，而 hiPSC 来源的星形胶质细胞常被用于神经系统疾病机制研究。本站将其分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病，说明该数据在疾病研究语境下具有相关性。主题标签为 Other，未进一步细分。
【数据内容】
该数据集的核心内容为 CROP-seq 单细胞 RNA 测序数据，研究对象是 hiPSC 来源的星形胶质细胞。CROP-seq 是一种将 CRISPR 扰动与单细胞转录组读取相结合的方法，可在单细胞水平上关联基因扰动与表达谱变化。单细胞 RNA 测序则用于获取单个细胞的转录组信息。该数据集即为这一组合策略下产生的数据集合。关于具体样本数量、细胞数、测序深度、扰动靶基因列表、数据文件格式与大小等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 755725，英文名称为 PRJNA755725。源站标题标明其为“CROP-seq of hiPSC-derived astrocytes (scRNA-Seq)”。BioProject 记录通常汇集来自单一机构或联合体的数据，但该项目的具体提交机构、研究团队、样本采集与制备流程、测序平台与建库方法等信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于神经系统疾病与阿尔茨海默病相关研究方向，尤其是围绕 hiPSC 来源星形胶质细胞的单细胞转录组分析。CROP-seq 数据可用于在单细胞水平上探索基因扰动对星形胶质细胞表达谱的影响，也可用于检索和复用该项目产生的多种数据类型。由于本站分类将其归入神经系统疾病 / 阿尔茨海默病，该数据可能对相关疾病机制、细胞模型以及扰动筛选研究具有参考价值。具体适用分析类型、可回答的生物学问题以及是否适合特定疾病模型，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库访问该记录，项目 ID 为 755725，英文名称为 PRJNA755725。BioProject 记录提供统一入口，用于查找该项目生成的不同数据类型。用户可根据源站标题与描述定位到 CROP-seq of hiPSC-derived astrocytes (scRNA-Seq) 这一项目，并进一步获取其关联数据。关于数据下载方式、文件组织、分析流程、预处理步骤以及配套代码或工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集为 BioProject 收录的项目记录，其数据质量、测序质量、细胞存活率、批次效应、扰动效率等具体指标，源站未提供。该数据集的主题标签为 Other，未给出更细粒度的质量控制信息。使用时应结合源站记录及关联数据自行评估适用性。关于样本量、重复数、对照设置、数据完整性以及潜在偏差，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发等信息，源站未提供。用户在使用该数据集时，应参考 NCBI BioProject 源站记录及相关数据页面获取引用与许可要求。关于具体许可类型、数据共享政策以及商业使用限制，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA755725
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
针对中枢神经系统损伤或疾病，星形胶质细胞会变为反应性，呈现出功能改变的、依赖于具体情境的状态。某些炎症性刺激可诱导反应性星形胶质细胞状态，使其丧失稳态功能并获得神经毒性，且可能促进神经炎症和神经退行性疾病。然而，控制这些状态的细胞通路尚未被完全理解。在此，我们将单细胞转录组学与人类iPSC来源星形胶质细胞中的CRISPRi筛选相结合，以系统性地探究炎症反应性。我们发现，经典NF-kB激活下游的自分泌-旁分泌IL-6和干扰素信号分别驱动了两种不同的炎症反应性状态，分别依赖于STAT3和IRF1。此外，这些状态与在其他实验情境（包括体内）中观察到的状态相对应，并且其标志物在阿尔茨海默病和缺血缺氧性脑病的人类大脑中上调。这些结果以及我们建立的平台有潜力指导开发能够选择性调节炎症性星形胶质细胞反应性不同方面的治疗手段。
总体设计：将稳定整合了CRISPRi机制的hiPSC来源星形胶质细胞（iAstrocytes）用CROP-seq载体（Datlinger等，PMID：28099430）中的慢病毒sgRNA文库转导，以敲低一组假设控制炎症反应性的基因。随后，用载体（Veh）或IL1a+TNF+C1q（ITC）处理iAstrocytes以诱导炎症反应性，然后使用10x v3进行单细胞RNA测序。通过从10x cDNA中对含有sgRNA序列的poly-腺苷酸化转录本进行靶向PCR富集，回收每个细胞的sgRNA身份（参见Datlinger等）。该数据集包括10x RNA文库以及CROP-seq PCR富集文库。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
