基本信息

模态

基因组

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

CHCHD10 通过调控直接重编程神经元表观遗传景观缓解阿尔茨海默病发病机制

该数据集对应 NCBI BioProject 编号 1454081，英文标题为“CHCHD10 alleviates Alzheimer’s Disease Pathogenesis by Modulating Epigenetic Landscape in Directly Reprogrammed Neurons”。从标题可以看出，该研究聚焦于 CHCHD10 在阿尔茨海默病发病机制中的作用，并强调其通过调控直接重编程神经元中的表观遗传景观来发挥缓解效应。数据集在分类上归属于神经系统疾病下的阿尔茨海默病方向，主题标签为表观遗传学（Epigenomics），来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，这是一个围绕特定神经疾病机制研究而形成的生物项目记录，旨在为相关数据提供统一的入口与关联信息。

【数据集背景】

该数据集来自 NCBI BioProject，编号为 1454081。BioProject 是围绕某一项单一研究计划或倡议而汇集的一组生物学数据，这些数据可能来自一个机构，也可能来自一个联合体。BioProject 记录的核心作用，是为用户提供一个统一的位置，以便查找该项目所产生的多种类型数据及其相关链接。因此，该数据集并非单一实验的原始数据文件，而是一个项目级别的元数据入口，指向与 CHCHD10、阿尔茨海默病以及直接重编程神经元表观遗传调控相关的研究内容。其分类落在神经系统疾病与阿尔茨海默病方向，主题标签为表观遗传学，说明该项目在数据组织上被归入表观遗传相关研究范畴。

【数据内容】

该数据集的主题围绕 CHCHD10 通过调控直接重编程神经元中的表观遗传景观来缓解阿尔茨海默病发病机制。由此可知，项目所涉及的数据类型与表观遗传学相关，并服务于阿尔茨海默病发病机制的研究。不过，关于具体的数据模态、样本数量、测序平台、基因组坐标、分析结果文件、图表或统计指标等细节，源站未提供。因此，无法进一步说明该项目包含哪些具体的数据文件、数据规模或数据格式。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，属于 NCBI BioProject 数据库中的记录，项目编号为 1454081。其源站标题为“CHCHD10 alleviates Alzheimer’s Disease Pathogenesi... (ID 1454081) - BioProject - NCBI”。关于样本采集方式、实验设计、受试者或模型来源、时间范围、地理范围、伦理审批信息以及具体提交机构等，源站未提供。

【适用场景】

基于现有信息，该数据集适用于与阿尔茨海默病发病机制、CHCHD10 功能以及直接重编程神经元中表观遗传调控相关的研究场景。由于主题标签为表观遗传学，它可能被用于查找或关联该 BioProject 下的表观遗传数据。但关于具体适用分析类型、可支持的研究问题、是否可用于临床诊断或药物开发等，源站未提供。

【使用方法】

该数据集作为 NCBI BioProject 记录，可通过其项目编号 1454081 在 NCBI BioProject 中定位，并借助 BioProject 记录提供的链接查找该项目产生的多种数据类型。关于具体的数据下载方式、访问权限、所需工具、分析流程或使用步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 BioProject 项目级记录，其描述强调 BioProject 作为单一研究计划相关生物学数据的集合，并提供查找多种数据类型的统一入口。关于数据质量评估、完整性、准确性、覆盖度、偏差、版本更新情况以及使用限制等，源站未提供。

【引用与许可】

关于该数据集的引用格式、许可协议、使用条款、版权归属或数据共享政策，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE328184

访问原始数据

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1454081

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病（AD）与广泛的表观遗传改变相关，包括DNA甲基化变化。CHCHD10是一种线粒体膜间隙蛋白，已被认为与线粒体功能和神经退行性变有关，但其在表观遗传调控中的作用仍不清楚。在本研究中，我们对来自认知正常对照（NC）和AD患者的成纤维细胞来源诱导神经元进行了全基因组DNA甲基化谱分析，分别在有和无CHCHD10过表达的条件下。我们识别了与疾病相关的差异甲基化区域（DMRs），并评估了CHCHD10恢复在多大程度上调节这些表观遗传特征。该数据集为理解AD中线粒体-表观遗传相互作用提供了资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别