基本信息

模态

蛋白质

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

I型干扰素驱动中枢神经系统T细胞对amyloid-beta的应答

该数据集为 NCBI BioProject 收录项目，编号 1442205，英文名称为“Type-I Interferon drives T-cell responses to amyloid-beta in the central nervous system”。从名称可以看出，该项目围绕 I 型干扰素在驱动中枢神经系统内 T 细胞针对 amyloid-beta（β-淀粉样蛋白）产生应答这一主题展开。数据集在分类上归属于神经系统疾病，并进一步指向阿尔茨海默病方向，主题标签为“Other”。其来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题显示为“Type-I Interferon drives T-cell responses to amylo... (ID 1442205) - BioProject - NCBI”。整体而言，这是一项与神经免疫及阿尔茨海默病机制研究相关的生物项目记录，可供查找该项目所关联的多种数据类型。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目记录形式，用于汇集与某一项研究计划相关的生物数据。按照源站描述，一个 BioProject 通常来自单一机构或联合体，围绕同一项研究倡议而建立，并为用户提供一个统一入口，以便找到该项目所产生的不同类型的数据。编号 1442205 的项目即属于此类记录，其研究主题聚焦于 I 型干扰素如何驱动中枢神经系统内 T 细胞对 amyloid-beta 的应答。该主题同时涉及神经系统疾病与免疫应答机制，因此在分类上被归入神经系统疾病／阿尔茨海默病方向。主题标签为“Other”，说明其标签体系未将其归入更具体的既有类别。

【数据内容】

源站未提供该项目所包含的具体数据内容细节。根据 BioProject 的一般性质，其记录用于链接同一项目下产生的多种数据类型，但本项目实际包含哪些样本、测序数据、表达数据或其他生物数据，源站未提供。因此，无法从现有信息中确认其数据文件类型、数据量、样本数量或具体实验测定内容。

【采集与来源】

该数据集来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Type-I Interferon drives T-cell responses to amylo... (ID 1442205) - BioProject - NCBI”。其项目编号为 1442205，英文名称为“Type-I Interferon drives T-cell responses to amyloid-beta in the central nervous system”。关于样本采集方式、采集地点、采集时间、机构来源等具体信息，源站未提供。

【适用场景】

基于项目主题，该数据集可能适用于与 I 型干扰素、中枢神经系统 T 细胞应答、amyloid-beta 以及阿尔茨海默病相关的神经免疫研究场景。其分类为神经系统疾病／阿尔茨海默病，主题标签为“Other”，因此也可作为该方向项目记录的检索入口。但具体适用场景需结合项目实际数据内容判断，源站未提供更详细的适用说明。

【使用方法】

源站未提供具体使用方法。通常 BioProject 记录可作为查找同一项目下多种数据类型的统一入口，但针对编号 1442205 的项目，如何下载、访问或分析其数据，源站未提供。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量、完整性、准确性或使用限制的具体说明。现有信息仅能确认该项目为 NCBI BioProject 记录，编号 1442205，主题与 I 型干扰素驱动中枢神经系统 T 细胞对 amyloid-beta 的应答相关，归类于神经系统疾病／阿尔茨海默病，主题标签为“Other”。其他质量与限制信息源站未提供。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用格式、许可条款或使用授权信息。如需引用或使用，应参考 NCBI BioProject 源站页面中可能提供的相关说明，但具体内容源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE325911

访问原始数据

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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1442205

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该存储库包含来自13月龄和24月龄APP23^het转基因小鼠与野生型小鼠大脑皮层切片，以及人类阿尔茨海默病皮层组织的原始及处理后靶向空间转录组学数据。空间分析采用Molecular Cartography™平台（Resolve Biosciences）进行，这是一种基于成像的高度多重单分子荧光原位杂交（smFISH）技术。数据集包括原始转录本坐标文件，以及由该平台分割算法生成的细胞分割输出。研究同时进行了无分割（基于转录本）和基于分割的空间分析。这些数据用于探究淀粉样斑块相关区域中年龄依赖性的免疫细胞组成及T细胞表型的空间富集情况，详情见相关手稿。详细的实验流程、基因面板、预处理步骤、归一化、聚类及空间分析方法，请参见出版物中的方法部分。

总体设计：小鼠：对总共8个冷冻保存的APP23-tg和Wt小鼠大脑的皮层冠状切片（每组n = 2）使用Molecular Cartography™平台（Resolve Biosciences）进行靶向空间转录组学分析。每只小鼠分析一个大脑半球。人类：使用来自总共4名患者的阿尔茨海默病大脑皮层组织，将1cm3冷冻保存的组织芯切片，每位患者取两张切片使用Molecular Cartography™平台（Resolve Biosciences）进行空间转录组学分析。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别