阿尔茨海默病、CADASIL与创伤性脑损伤小鼠模型中小胶质细胞异质性反应与稳定血管转录程序对比(ArcSwe数据)

数据覆盖阿尔茨海默病、CADASIL和创伤性脑损伤小鼠模型,聚焦小胶质细胞异质性反应与血管转录程序的对比,可用于研究不同神经系统疾病模型中小胶质细胞转录特征的异同及血管相关基因表达稳定性(来源 NCBI)

sra
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时间序列分类GPL2424710090
PRJNA1420889: Heterogenous microglial reactivity contrasts with stable vascular transcriptional programs in mouse models of Alzheimer’s, CADASIL, and Traumatic Brain Injury (ArcSwe data)

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-21

资源简介

阿尔茨海默病、CADASIL与创伤性脑损伤小鼠模型中小胶质细胞异质性反应与稳定血管转录程序对比(ArcSwe数据)

Targeting microglial phosphatidylethanolamine synthesis pathway promotes GABARAP-associated phagocytosis and A clearance in Alzheimer's disease

该数据集来自NCBI,包含1个文件(GSE327618_series_matrix.txt.gz),主题为高通量测序表达谱分析,物种为小鼠(10090),平台为GPL24247。数据覆盖阿尔茨海默病、CADASIL和创伤性脑损伤小鼠模型,聚焦小胶质细胞异质性反应与血管转录程序的对比,可用于研究不同神经系统疾病模型中小胶质细胞转录特征的异同及血管相关基因表达稳定性(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 10 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):阿尔茨海默病(AD)是痴呆的主要原因,也是一种常见的年龄相关神经退行性疾病,其特征是进行性认知障碍和记忆丧失。尽管小胶质细胞的代谢激活或功能障碍被认为与AD发病机制有关,但小胶质细胞内与磷脂代谢相关的信号机制仍鲜有明确。在本研究中,我们证明喹啉酸(QA),一种通过犬尿氨酸途径进行色氨酸分解代谢的副产物,通过上调酶EPT1和ETNK1激活小胶质细胞的Kennedy途径——该途径负责从头合成磷脂酰乙醇胺(PE)。这种激活显著增强了富含多不饱和脂肪酸的PE种类的合成。同时,QA显著增加γ-氨基丁酸受体相关蛋白(GABARAP)的表达,促进其脂化,并fac

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL24247、10090。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327618

【使用注意】

· 源站最后修改于 Jul 22 202,引用时请注意版本时效。

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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE327618

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
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  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

脑血管在各种脑部疾病中受影响的程度仍未被充分了解。为解决这一问题,我们建立了一个包含主要血管细胞类型和小胶质细胞的转录组库,以比较三种与神经炎症及相关血管反应性有关的人类脑部疾病小鼠模型中的转录组反应:阿尔茨海默病(AD)、创伤性脑损伤(TBI)以及伴皮质下梗死和白质脑病的常染色体显性遗传性脑动脉病(CADASIL)。对不同疾病阶段的超过250,000个细胞进行单细胞分析,鉴定出两种此前未知的血管细胞亚型,扩展了内皮分区谱,并使得对血管细胞和小胶质细胞中分子反应的详细分析成为可能。出乎意料的是,在三种条件下,所有血管细胞类型在转录组上均保持正常,而小胶质细胞则表现出显著的、疾病特异性的转录变化。值得注意的是,小胶质细胞的反应在晚期TBI和AD之间趋同,为TBI后神经退行性变的易感性提供了新的见解。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

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