PRJNA1150582：吸入氙气调节小胶质细胞并改善淀粉样变性和tau蛋白病小鼠模型[Tau]

数据集获取

源站：https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1150582

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数据说明

阿尔茨海默病（AD）是最常见的神经退行性疾病。目前，抗淀粉样蛋白抗体治疗可轻度延缓AD所致轻度痴呆的疾病进展。新出现的证据表明，脑免疫系统的稳态失调，尤其是由小胶质细胞所主导的稳态失调，在疾病的发病和进展中发挥重要作用，包括神经炎症和氧化应激的增加。因此，一个主要问题是如何调控小胶质细胞的表型和功能以治疗AD。氙气（Xe）是一种惰性气体，在人类患者中用作麻醉剂和神经保护剂以治疗脑损伤。Xe可穿透血脑屏障，这使其成为一种有效的治疗手段。我们在急性神经退行性变模型和具有AD样病理改变的小鼠模型（即5xFAD（淀粉样蛋白）和P301S（tau））中发现，吸入Xe可使小鼠和人类小胶质细胞极化为一种中间激活状态，我们将其命名为“pre-MGnD”。这种小胶质细胞表型转变增强了淀粉样斑块的致密化并减少了营养不良性神经突。此外，吸入Xe可减轻APOE4:P301S小鼠的脑萎缩和神经炎症，并改善其筑巢行为。

在机制上，氙气吸入通过IFN信号通路使稳态小胶质细胞极化为pre-MGnD状态，该状态维持小胶质细胞的吞噬反应，同时抑制其促炎特性。这些结果支持将氙气吸入作为一种治疗AD的新型方法进行转化。总体设计：从6月龄至9.5月龄，TE4（P301S APOE4）小鼠每周接受一次为期40分钟的30%氙气或大气空气（对照）处理。在9.5月龄时，处死小鼠并采集组织。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。