吸入氙气调节小胶质细胞并改善淀粉样变性和tau蛋白病小鼠模型疾病[5xFAD-MITRG星形胶质细胞6月龄]

阿尔茨海默病(AD)是最常见的神经退行性疾病。目前,抗淀粉样蛋白抗体治疗对AD所致轻度痴呆的疾病进展仅有适度延缓作用。新出现的证据表明,脑免疫系统的稳态失调,尤其是由小胶质细胞所协调的稳态失调,在疾病的发病和进展中起重要作用,包括神经炎症和氧化应激的增加

ena
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基因组分类阿尔茨海默病小胶质细胞氙气吸入神经炎症5xFAD小鼠tau蛋白病星形胶质细胞
PRJNA1131372: Inhaled Xenon modulates microglia and ameliorates disease in mouse models of amyloidosis and tauopathy [5xFAD-MITRG Astrocytes 6M]

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

吸入氙气调节小胶质细胞并改善淀粉样变性和tau蛋白病小鼠模型疾病[5xFAD-MITRG星形胶质细胞6月龄]

PRJNA1131372 数据集对应一项关于吸入氙气(Xenon, Xe)调控小胶质细胞并改善淀粉样变性与tau病变小鼠模型疾病表现的研究,其子集聚焦于6月龄5xFAD小鼠的MITRG星形胶质细胞。该数据集归属于神经系统疾病 / 阿尔茨海默病分类,来源于ebi.ac.uk。阿尔茨海默病是最常见的神经退行性疾病,现有抗淀粉样蛋白抗体治疗对轻度痴呆的疾病进展仅有适度延缓作用;脑免疫系统稳态失调,尤其是小胶质细胞协调的稳态失调,在疾病发病和进展中起重要作用,涉及神经炎症和氧化应激的增加。该数据集为探索通过调控小胶质细胞表型与功能治疗阿尔茨海默病的研究提供了相关数据资源。

【数据集背景】

阿尔茨海默病(AD)是最常见的神经退行性疾病。目前,抗淀粉样蛋白抗体治疗对AD所致轻度痴呆的疾病进展仅有适度延缓作用。新出现的证据表明,脑免疫系统的稳态失调,尤其是由小胶质细胞所协调的稳态失调,在疾病的发病和进展中起重要作用,包括神经炎症和氧化应激的增加。因此,如何调控小胶质细胞的表型和功能以治疗AD成为一个重要问题。氙气(Xe)是一种惰性气体,已在人类患者中用作麻醉剂和治疗脑损伤的神经保护剂。Xe可穿透血脑屏障,这使其可能成为有效的治疗手段。研究已识别出,在急性神经退行性模型中,吸入Xe可使小鼠和人类小胶质细胞极化为一种中间激活状态,研究者将其称为“pre-MGnD”。该数据集即围绕吸入氙气对小鼠模型中小胶质细胞及疾病表现的影响展开。

【数据内容】

该数据集英文名称为“PRJNA1131372: Inhaled Xenon modulates microglia and ameliorates disease in mouse models of amyloidosis and tauopathy [5xFAD-MITRG Astrocytes 6M]”,其子集指向6月龄5xFAD小鼠的MITRG星形胶质细胞。数据集分类为神经系统疾病 / 阿尔茨海默病。关于样本数量、测序平台、数据文件类型与大小等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源站为ebi.ac.uk。源站描述涉及阿尔茨海默病背景、小胶质细胞稳态失调在疾病中的作用、氙气作为惰性气体的神经保护潜力及其穿透血脑屏障的特性,以及吸入Xe使小鼠和人类小胶质细胞极化为“pre-MGnD”中间激活状态的发现。关于具体采集地点、采集时间、实验动物饲养条件与伦理审批信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经退行性疾病尤其是阿尔茨海默病相关研究,可用于探索小胶质细胞表型与功能调控、神经炎症与氧化应激机制,以及吸入氙气在淀粉样变性与tau病变小鼠模型中的治疗作用研究。关于其他具体适用场景,源站未提供。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法,包括数据下载方式、预处理流程、分析工具与参数设置等。

【质量与限制】

源站未提供该数据集的质量评估信息与使用限制说明。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。

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数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA1131372

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

阿尔茨海默病(AD)是最常见的神经退行性疾病。目前,抗淀粉样蛋白抗体治疗可轻度延缓AD所致轻度痴呆的疾病进展。新出现的证据表明,脑免疫系统的稳态失调,尤其是由小胶质细胞所主导的稳态失调,在疾病的发病和进展中发挥重要作用,包括神经炎症和氧化应激的增加。因此,一个主要问题是如何调控小胶质细胞的表型和功能以治疗AD。氙气(Xe)是一种惰性气体,在人类患者中用作麻醉剂和神经保护剂以治疗脑损伤。Xe可穿透血脑屏障,这使其成为一种有效的治疗手段。我们在急性神经退行性变模型和具有AD样病理改变的小鼠模型(即5xFAD(淀粉样蛋白)和P301S(tau))中发现,吸入Xe可使小鼠和人类小胶质细胞极化为一种中间激活状态,我们将其命名为“pre-MGnD”。这种小胶质细胞表型转变增强了淀粉样斑块的致密化并减少了营养不良性神经突。此外,吸入Xe可减轻APOE4:P301S小鼠的脑萎缩和神经炎症,并改善其筑巢行为。

在机制上,氙气吸入通过IFN信号通路使稳态小胶质细胞极化为pre-MGnD状态,该信号通路维持小胶质细胞的吞噬反应,同时抑制其促炎特性。这些结果支持将氙气吸入作为一种治疗AD的新型方法进行转化。总体设计:在4月龄的5xFAD-MITRG小鼠中开始氙气治疗(30%氙气,每周一次,每次40分钟),并持续每周一次直至动物达到6月龄。通过FACS Aria分选星形胶质细胞,并使用总RNA进行RNAseq。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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