阿尔茨海默病、高病理对照与正常受试者皮层组织miRNA PCR Array数据集

该数据集来源于omicsdi.org,收录了来自Rush队列的脑组织样本,涵盖阿尔茨海默病受试者、高病理对照和正常对照三类人群

omicsdi
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基因组分类Transcriptomics
miRNA PCR Array of cortex tissue from Alzheimer disease (AD), high pathological control (HPC) and normal (CTL)subjects

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

阿尔茨海默病、高病理对照与正常受试者皮层组织miRNA PCR Array数据集

该数据集为一份微小RNA(miRNA)表达谱数据,英文名称为“miRNA PCR Array of cortex tissue from Alzheimer disease (AD), high pathological control (HPC) and normal (CTL) subjects”,在来源站点中归类于神经系统疾病下的阿尔茨海默病方向,主题标签为转录组学(Transcriptomics)。数据来源于omicsdi.org,收录了来自Rush队列的脑组织样本,涵盖阿尔茨海默病受试者、高病理对照和正常对照三类人群,通过miRNA阵列评估脑组织中微小RNA的水平。该数据集为在转录组层面比较阿尔茨海默病与不同病理状态对照之间的miRNA表达差异提供了样本资源,适合用于神经系统疾病分子机制相关的探索性研究。

【数据集背景】

阿尔茨海默病是一种以认知功能进行性减退为主要表现的神经退行性疾病,其脑组织中的分子改变涉及转录后调控等多个层面。微小RNA作为一类重要的转录后调控分子,在脑组织中的表达变化被认为可能与疾病过程相关。该数据集正是围绕这一背景构建,旨在通过miRNA阵列技术评估脑组织中微小RNA的水平,并将阿尔茨海默病受试者与高病理对照及正常对照进行对比,从而为理解疾病相关的miRNA表达特征提供数据基础。数据集在分类上归属于神经系统疾病/阿尔茨海默病,主题标签为转录组学,体现了其在神经疾病转录调控研究中的定位。

【数据内容】

该数据集的核心内容是脑皮质组织的miRNA表达谱数据,检测对象为微小RNA。样本按受试者状态分为三类:阿尔茨海默病受试者、高病理对照受试者和正常对照受试者。数据以miRNA阵列为检测平台,反映各样本中微小RNA的水平。除上述样本分组与检测对象信息外,源站未提供关于具体miRNA数量、检测通量、表达矩阵格式或数据文件组织的进一步说明。

【采集与来源】

数据来源于omicsdi.org,样本取自Rush队列的脑组织。源站描述表明,这些数据评估的是来自对照、高病理对照和阿尔茨海默病受试者脑组织中的微小RNA水平,样本经整理后纳入该数据集。关于样本采集的具体流程、伦理审批信息、脑组织取材部位的具体解剖定位以及样本量等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于神经退行性疾病领域的转录组学研究,尤其是围绕阿尔茨海默病脑组织中miRNA表达变化的探索性分析。研究者可将其用于比较阿尔茨海默病与正常对照之间的miRNA表达差异,也可用于考察高病理对照这一中间状态下的表达特征,从而辅助识别与疾病病理相关的候选miRNA。此外,该数据还可作为脑组织转录调控研究的参考数据,用于方法学验证或与其他转录组数据集的整合分析。需要说明的是,上述适用方向基于数据集的样本构成与检测对象,具体分析可行性需结合数据实际内容判断。

【使用方法】

源站未提供关于数据下载方式、文件格式、预处理流程或分析工具的具体说明。使用者在获取数据后,应根据自身研究目的确定分析策略,并在使用前核实数据的组织方式与样本标注。由于该数据集涉及三类受试者的分组比较,分析时需注意组间对照关系的正确设置。

【质量与限制】

源站未提供关于数据质量评估、缺失值处理、批次效应控制或技术重复等方面的信息。该数据集基于Rush队列的脑组织样本,样本来源相对集中,其结论的外推需谨慎。此外,高病理对照组的定义与纳入标准、疾病诊断依据等细节,源站未提供,使用者在解释组间差异时应予以考虑。

【引用与许可】

源站未提供该数据集的引用规范、许可协议或使用条款信息。使用者在引用或再利用该数据前,应自行向数据来源方确认相关要求。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MTAB-8283

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

这些数据通过miRNA芯片评估了来自Rush队列的对照、高病理对照和阿尔茨海默病受试者脑组织中microRNA的水平。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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