锁定468基因面板及AD、ASD、PD、MS、ALS疾病内转录组荟萃分析方法

该数据集为神经系统疾病转录组荟萃分析资源,包含锁定468基因面板及阿尔茨海默病、自闭症谱系障碍、帕金森病、多发性硬化、肌萎缩侧索硬化的疾病内荟萃分析方法

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基因组预测transcriptomicsredox biologygene panelmeta-analysisgeoAlzheimer DiseaseParkinson diseasemultiple sclerosisASDALSautism
Locked 468-gene panel and methods for within-disease transcriptomic meta-analyses of AD, ASD, PD, MS, and ALS

基本信息

模态
基因组
大小
0.006320207 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-20
版本
1.3

资源简介

锁定468基因面板及AD、ASD、PD、MS、ALS疾病内转录组荟萃分析方法

Locked 468-gene panel and methods for within-disease transcriptomic meta-analyses of AD, ASD, PD, MS, and ALS

该数据集为神经系统疾病转录组荟萃分析资源,包含锁定468基因面板及阿尔茨海默病、自闭症谱系障碍、帕金森病、多发性硬化、肌萎缩侧索硬化的疾病内荟萃分析方法。提供阿尔茨海默病六队列荟萃分析的可复现输入表与脚本,以及帕金森病逐基因荟萃分析表。可用于基因表达元分析、生物标志物筛选与结果复现(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):版本1.3(2026年9月)。新增AD_meta_reproduction_package.zip:包含逐队列输入表和脚本,可逐基因复现阿尔茨海默病六队列荟萃分析(458个可分析基因/167个FDR显著基因/141个高置信度基因),以及修订版阿尔茨海默病手稿(表S4)中报告的敏感性分析。468基因面板、排除列表、高置信度规则和锁定计数均未更改。版本1.2(2026年9月)。新增帕金森病逐基因荟萃分析表(419个可分析基因、91个FDR显著基因、56个高置信度基因),作为独立工作簿和CSV提供,并附有锁定的队列对比定义;该表与版本1.1中CONSOLIDATED_468_FINAL_7.6.26.xlsx的PD工作表相同。新增definitions_locked.csv(状态FINAL)和一份README,该README更正了版本1.1 README中的两处陈述:10.5281/ze

【主题与分类】

主题标签:transcriptomics、redox biology、gene panel、meta-analysis、geo、Alzheimer Disease、Parkinson disease、multiple sclerosis、ASD、ALS。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22178093

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 6.3 MB。

数据说明

版本1.3(2026年9月)。新增AD_meta_reproduction_package.zip:包含各队列输入表及脚本,可逐基因复现阿尔茨海默病六队列荟萃分析(458个可分析基因/167个FDR显著基因/141个高置信度基因),并附修订版阿尔茨海默病稿件中报告的敏感性分析(表S4)。468基因面板、排除列表、高置信度规则及锁定计数均未变更。版本1.2(2026年9月)。新增帕金森病逐基因荟萃分析表(419个可分析基因、91个FDR显著基因、56个高置信度基因),以独立工作簿和CSV格式提供,并附锁定的队列对比定义;该表与版本1.1中CONSOLIDATED_468_FINAL_7.6.26.xlsx的PD工作表完全相同。新增definitions_locked.csv(状态为FINAL)及一份README,后者更正了版本1.1 README中的两处表述:10.5281/zenodo.22178094是版本1.0的记录DOI,而非概念DOI(所有版本DOI为10.5281/zenodo.22178093);疾病解析配套论文发布于Research Square而非SSRN,方法与面板稿件正在Molecular Neurobiology审稿中。

468基因面板、22符号排除列表、高置信度规则、锁定计数以及流程均与1.0版保持一致。ORCID iD:0000-0003-2059-622X

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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