锁定468基因面板及AD、ASD、PD、MS、ALS疾病内转录组荟萃分析方法
该数据集为神经系统疾病转录组荟萃分析资源,包含锁定468基因面板及阿尔茨海默病、自闭症谱系障碍、帕金森病、多发性硬化、肌萎缩侧索硬化的疾病内荟萃分析方法

基本信息
资源简介
锁定468基因面板及AD、ASD、PD、MS、ALS疾病内转录组荟萃分析方法
Locked 468-gene panel and methods for within-disease transcriptomic meta-analyses of AD, ASD, PD, MS, and ALS
该数据集为神经系统疾病转录组荟萃分析资源,包含锁定468基因面板及阿尔茨海默病、自闭症谱系障碍、帕金森病、多发性硬化、肌萎缩侧索硬化的疾病内荟萃分析方法。提供阿尔茨海默病六队列荟萃分析的可复现输入表与脚本,以及帕金森病逐基因荟萃分析表。可用于基因表达元分析、生物标志物筛选与结果复现(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 International 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):版本1.3(2026年9月)。新增AD_meta_reproduction_package.zip:包含逐队列输入表和脚本,可逐基因复现阿尔茨海默病六队列荟萃分析(458个可分析基因/167个FDR显著基因/141个高置信度基因),以及修订版阿尔茨海默病手稿(表S4)中报告的敏感性分析。468基因面板、排除列表、高置信度规则和锁定计数均未更改。版本1.2(2026年9月)。新增帕金森病逐基因荟萃分析表(419个可分析基因、91个FDR显著基因、56个高置信度基因),作为独立工作簿和CSV提供,并附有锁定的队列对比定义;该表与版本1.1中CONSOLIDATED_468_FINAL_7.6.26.xlsx的PD工作表相同。新增definitions_locked.csv(状态FINAL)和一份README,该README更正了版本1.1 README中的两处陈述:10.5281/ze
【主题与分类】
主题标签:transcriptomics、redox biology、gene panel、meta-analysis、geo、Alzheimer Disease、Parkinson disease、multiple sclerosis、ASD、ALS。本站分类:神经系统疾病/阿尔茨海默病。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22178093
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22178093
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 6.3 MB。
数据说明
版本1.3(2026年9月)。新增AD_meta_reproduction_package.zip:包含各队列输入表及脚本,可逐基因复现阿尔茨海默病六队列荟萃分析(458个可分析基因/167个FDR显著基因/141个高置信度基因),并附修订版阿尔茨海默病稿件中报告的敏感性分析(表S4)。468基因面板、排除列表、高置信度规则及锁定计数均未变更。版本1.2(2026年9月)。新增帕金森病逐基因荟萃分析表(419个可分析基因、91个FDR显著基因、56个高置信度基因),以独立工作簿和CSV格式提供,并附锁定的队列对比定义;该表与版本1.1中CONSOLIDATED_468_FINAL_7.6.26.xlsx的PD工作表完全相同。新增definitions_locked.csv(状态为FINAL)及一份README,后者更正了版本1.1 README中的两处表述:10.5281/zenodo.22178094是版本1.0的记录DOI,而非概念DOI(所有版本DOI为10.5281/zenodo.22178093);疾病解析配套论文发布于Research Square而非SSRN,方法与面板稿件正在Molecular Neurobiology审稿中。
468基因面板、22符号排除列表、高置信度规则、锁定计数以及流程均与1.0版保持一致。ORCID iD:0000-0003-2059-622X
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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